More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1917 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 		 246 aa  508  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  80.49 
 
 		 246 aa  418  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  72.13 
 
 		 256 aa  377  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  70.25 
 
 		 249 aa  362  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  69.42 
 
 		 249 aa  358  5e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.26 
 
 		 251 aa  341  5.999999999999999e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.26 
 
 		 246 aa  337  8e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  57.08 
 
 		 240 aa  285  7e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.07 
 
 		 253 aa  278  8e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.07 
 
 		 253 aa  278  8e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  54.24 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  52.1 
 
 		 285 aa  272  3e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  53.59 
 
 		 276 aa  271  7e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  52.32 
 
 		 245 aa  270  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  51.28 
 
 		 246 aa  269  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  54.47 
 
 		 253 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  52.97 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  50.64 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  52.81 
 
 		 266 aa  264  8e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  51.46 
 
 		 282 aa  264  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  50.84 
 
 		 276 aa  262  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  51.74 
 
 		 263 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  48.37 
 
 		 248 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  51.27 
 
 		 246 aa  258  8e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.64 
 
 		 257 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  52.4 
 
 		 273 aa  255  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  49.79 
 
 		 260 aa  255  5e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 		 258 aa  253  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 		 258 aa  251  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 		 258 aa  251  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 		 258 aa  251  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 		 258 aa  251  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 		 258 aa  251  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 		 258 aa  251  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 		 258 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.74 
 
 		 259 aa  250  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  48.5 
 
 		 257 aa  250  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 		 258 aa  250  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 		 241 aa  249  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.58 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.25 
 
 		 258 aa  248  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.25 
 
 		 257 aa  248  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  52.1 
 
 		 255 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.15 
 
 		 258 aa  248  9e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.21 
 
 		 282 aa  247  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  48.94 
 
 		 291 aa  246  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  51.08 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  48.1 
 
 		 251 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  48.1 
 
 		 251 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  47.68 
 
 		 251 aa  244  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  47.48 
 
 		 251 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.61 
 
 		 251 aa  243  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.86 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.5 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  49.18 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.03 
 
 		 252 aa  241  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  50.63 
 
 		 250 aa  241  6e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 		 249 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  51.71 
 
 		 247 aa  241  7e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  48.73 
 
 		 254 aa  241  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  48.57 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.36 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.1 
 
 		 254 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.92 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  48.36 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0265  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  48.36 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  47.62 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 		 249 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3725  undecaprenyl diphosphate synthase  54.7 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3651  undecaprenyl diphosphate synthase  54.7 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.86266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.14 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.66 
 
 		 254 aa  239  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  47.76 
 
 		 260 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.16 
 
 		 260 aa  238  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  47.76 
 
 		 260 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  47.76 
 
 		 260 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  47.95 
 
 		 260 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.06 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  47.95 
 
 		 260 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45.83 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  47.76 
 
 		 260 aa  238  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  47.95 
 
 		 260 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.36 
 
 		 260 aa  238  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  47.95 
 
 		 260 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  47.76 
 
 		 260 aa  238  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  48.36 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  46.03 
 
 		 251 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  47.54 
 
 		 260 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 		 244 aa  238  6.999999999999999e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  46.25 
 
 		 256 aa  238  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.01 
 
 		 250 aa  238  9e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.03 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3585  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.99 
 
 		 251 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  46.29 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.21 
 
 		 267 aa  236  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0645618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>