More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3833 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3833  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
260 aa  523  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0123862 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  69.14 
 
 
266 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  67.09 
 
 
255 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.24 
 
 
252 aa  315  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.25 
 
 
251 aa  315  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.45 
 
 
252 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.83 
 
 
252 aa  310  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.09 
 
 
252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.09 
 
 
252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.03 
 
 
254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.88 
 
 
252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.6 
 
 
254 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.19 
 
 
255 aa  300  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.43 
 
 
237 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  64.1 
 
 
257 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.09 
 
 
252 aa  297  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  62.77 
 
 
259 aa  295  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  62.77 
 
 
259 aa  295  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.3 
 
 
248 aa  292  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  59.32 
 
 
247 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  61.37 
 
 
259 aa  288  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  58.05 
 
 
247 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  63.25 
 
 
267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  56.54 
 
 
254 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.28 
 
 
244 aa  265  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  52.89 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.32 
 
 
249 aa  245  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
251 aa  245  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.41 
 
 
245 aa  243  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.32 
 
 
243 aa  243  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.44 
 
 
249 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  53.95 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
246 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.08 
 
 
249 aa  238  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  49.56 
 
 
259 aa  238  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.08 
 
 
249 aa  238  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  46.34 
 
 
266 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.74 
 
 
249 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.91 
 
 
246 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.25 
 
 
248 aa  237  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  49.14 
 
 
248 aa  236  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.48 
 
 
246 aa  236  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.08 
 
 
249 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.71 
 
 
267 aa  235  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.78 
 
 
259 aa  235  7e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  45.69 
 
 
240 aa  234  7e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.52 
 
 
251 aa  234  8e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  47.21 
 
 
243 aa  234  8e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.05 
 
 
256 aa  234  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.59 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.66 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  44.58 
 
 
249 aa  233  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.61 
 
 
266 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  47.74 
 
 
264 aa  231  7.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2707  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.95 
 
 
247 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1364  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
247 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  46.96 
 
 
234 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  44.02 
 
 
263 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  42.86 
 
 
272 aa  230  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  49.12 
 
 
261 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.03 
 
 
260 aa  229  5e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  48.31 
 
 
241 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.44 
 
 
248 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.69 
 
 
233 aa  227  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.59 
 
 
238 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  47.81 
 
 
244 aa  225  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.78 
 
 
256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.02 
 
 
238 aa  225  6e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.56 
 
 
256 aa  224  7e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.58 
 
 
257 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  47.39 
 
 
251 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.02 
 
 
247 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.29 
 
 
256 aa  223  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.29 
 
 
256 aa  223  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  45.64 
 
 
247 aa  223  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.3 
 
 
267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.89 
 
 
256 aa  221  7e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1373  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.88 
 
 
236 aa  221  8e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0884424  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
260 aa  221  9e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.060942  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.26 
 
 
256 aa  221  9e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  45.45 
 
 
253 aa  221  9e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0052  undecaprenyl diphosphate synthase  44.16 
 
 
231 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000100505  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.16 
 
 
241 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  45.3 
 
 
245 aa  220  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.6 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  46.55 
 
 
236 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_002950  PG0190  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.763759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  46.44 
 
 
275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.72 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.93 
 
 
246 aa  219  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.59 
 
 
253 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.59 
 
 
253 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45.69 
 
 
252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  47.97 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2151  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0690  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.44 
 
 
270 aa  218  5e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000341789  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  43.97 
 
 
253 aa  218  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.92 
 
 
233 aa  218  7e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.29 
 
 
258 aa  218  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>