More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2712 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
246 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  72.36 
 
 
251 aa  377  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  67.48 
 
 
246 aa  353  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.26 
 
 
246 aa  350  8e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.53 
 
 
256 aa  347  8e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  67.21 
 
 
249 aa  346  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.39 
 
 
249 aa  340  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  53.97 
 
 
245 aa  285  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  55.19 
 
 
253 aa  281  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  55.74 
 
 
251 aa  274  8e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  54.39 
 
 
240 aa  268  5e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  53.59 
 
 
276 aa  268  7e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  53.62 
 
 
247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.67 
 
 
282 aa  265  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  53.75 
 
 
246 aa  264  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  50.42 
 
 
276 aa  263  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  51.87 
 
 
260 aa  263  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  51.27 
 
 
238 aa  262  3e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  50.41 
 
 
246 aa  262  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  52.54 
 
 
254 aa  262  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.48 
 
 
249 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  51.27 
 
 
272 aa  260  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
253 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
253 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  52.1 
 
 
285 aa  257  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
282 aa  257  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0190  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.21 
 
 
254 aa  256  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.763759 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.12 
 
 
249 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  52.36 
 
 
256 aa  256  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.69 
 
 
249 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.11 
 
 
244 aa  255  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  53.71 
 
 
273 aa  255  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.42 
 
 
252 aa  255  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.78 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  51.05 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  52.16 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  51.05 
 
 
251 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
249 aa  252  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  51.05 
 
 
251 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.63 
 
 
252 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  52.07 
 
 
248 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  51.05 
 
 
251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  50.84 
 
 
251 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.05 
 
 
252 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  49.58 
 
 
291 aa  251  6e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  50.84 
 
 
251 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.3 
 
 
254 aa  251  9.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.36 
 
 
259 aa  251  9.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.3 
 
 
254 aa  249  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.21 
 
 
252 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.72 
 
 
248 aa  250  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.85 
 
 
252 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  53.04 
 
 
259 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  53.04 
 
 
259 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.42 
 
 
248 aa  249  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.64 
 
 
257 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.21 
 
 
260 aa  248  4e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
255 aa  248  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.42 
 
 
247 aa  248  7e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
251 aa  248  7e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
263 aa  248  8e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  51.5 
 
 
247 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.09 
 
 
256 aa  247  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.38 
 
 
251 aa  247  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.86 
 
 
255 aa  246  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  51.08 
 
 
243 aa  246  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
261 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  48.91 
 
 
249 aa  246  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.36 
 
 
258 aa  246  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
247 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
254 aa  245  4e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  49.38 
 
 
260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  53.78 
 
 
255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.52 
 
 
241 aa  245  6e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.64 
 
 
248 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.87 
 
 
252 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.31 
 
 
249 aa  244  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  49.17 
 
 
261 aa  243  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38950  undecaprenyl diphosphate synthase  50.84 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.522438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0486  undecaprenyl diphosphate synthase  51.69 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.407745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.13 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4387  undecaprenyl diphosphate synthase  47.92 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.07 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.64 
 
 
251 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.37 
 
 
258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.37 
 
 
258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.37 
 
 
258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.37 
 
 
258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.25 
 
 
258 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  48.31 
 
 
257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.37 
 
 
258 aa  242  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.28 
 
 
238 aa  242  5e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.37 
 
 
258 aa  242  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.37 
 
 
258 aa  241  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.79 
 
 
251 aa  241  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  53.68 
 
 
259 aa  241  6e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.28 
 
 
238 aa  241  7e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>