More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4513 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
251 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  87.4 
 
 
252 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  86.9 
 
 
252 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  84.65 
 
 
252 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  84.25 
 
 
252 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  83.33 
 
 
252 aa  427  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  87.12 
 
 
252 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  66.8 
 
 
255 aa  329  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  67.09 
 
 
266 aa  325  5e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  69.83 
 
 
257 aa  325  6e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.38 
 
 
237 aa  320  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  70.09 
 
 
267 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.5 
 
 
255 aa  307  9e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.5 
 
 
254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.5 
 
 
254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  64.63 
 
 
254 aa  304  7e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3833  undecaprenyl diphosphate synthase  65.25 
 
 
260 aa  304  7e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0123862 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.92 
 
 
248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  62.55 
 
 
247 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  66.38 
 
 
259 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  66.38 
 
 
259 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.35 
 
 
252 aa  301  8.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  62.13 
 
 
247 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  67.1 
 
 
259 aa  289  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.23 
 
 
244 aa  286  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.41 
 
 
245 aa  270  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  56.89 
 
 
254 aa  255  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  51.04 
 
 
243 aa  248  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  51.63 
 
 
254 aa  246  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
233 aa  246  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.82 
 
 
248 aa  245  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.25 
 
 
256 aa  244  6.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  51.65 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.49 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
252 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  46.81 
 
 
248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
249 aa  242  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  55.26 
 
 
261 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.66 
 
 
251 aa  239  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  49.8 
 
 
260 aa  238  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.87 
 
 
243 aa  238  6.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  49.14 
 
 
234 aa  238  9e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  47.58 
 
 
282 aa  237  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  46.26 
 
 
256 aa  237  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.15 
 
 
249 aa  237  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  52.42 
 
 
261 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  48.39 
 
 
260 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2707  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.38 
 
 
247 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  51.26 
 
 
228 aa  236  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1364  undecaprenyl diphosphate synthase  49.38 
 
 
247 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  48.39 
 
 
260 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.39 
 
 
260 aa  235  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1373  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.81 
 
 
236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0884424  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
276 aa  235  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.28 
 
 
241 aa  234  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
266 aa  234  9e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  47.98 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.95 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  47.98 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  47.98 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  47.98 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  50.64 
 
 
236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.58 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  48.19 
 
 
260 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2151  undecaprenyl diphosphate synthase  51.03 
 
 
245 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  48.19 
 
 
260 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.83 
 
 
279 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
241 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  48.19 
 
 
260 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  48.19 
 
 
260 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  48.19 
 
 
260 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  46.29 
 
 
240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.19 
 
 
260 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  48.48 
 
 
240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.43 
 
 
259 aa  232  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.66 
 
 
265 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
253 aa  232  5e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
253 aa  232  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
261 aa  231  6e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.88 
 
 
267 aa  231  6e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0052  undecaprenyl diphosphate synthase  46.98 
 
 
231 aa  231  8.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000100505  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  48.9 
 
 
259 aa  231  9e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  48.28 
 
 
244 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.38 
 
 
246 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  46.37 
 
 
260 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.66 
 
 
233 aa  231  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  46.99 
 
 
260 aa  230  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.74 
 
 
255 aa  230  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.71 
 
 
245 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
264 aa  230  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.96 
 
 
249 aa  229  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  43.7 
 
 
239 aa  229  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  44.21 
 
 
261 aa  229  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.6 
 
 
267 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  47.15 
 
 
247 aa  229  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.38 
 
 
266 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  50 
 
 
252 aa  228  7e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.51 
 
 
255 aa  228  7e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.17 
 
 
267 aa  228  8e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
236 aa  228  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>