More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0827 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
256 aa  531  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  78.91 
 
 
256 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  78.91 
 
 
256 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.51 
 
 
257 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.7 
 
 
258 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.33 
 
 
249 aa  285  5e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0690  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.69 
 
 
270 aa  280  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000341789  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.28 
 
 
258 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.96 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.96 
 
 
257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.57 
 
 
258 aa  272  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.57 
 
 
258 aa  272  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.57 
 
 
258 aa  272  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.57 
 
 
258 aa  272  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.57 
 
 
258 aa  272  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.57 
 
 
258 aa  272  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.57 
 
 
258 aa  272  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.52 
 
 
258 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0979  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.47 
 
 
254 aa  270  1e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00602167  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.25 
 
 
250 aa  263  3e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0805  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.04 
 
 
239 aa  261  8e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655328  hitchhiker  0.0000000226437 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.6 
 
 
259 aa  256  2e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2435  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.86 
 
 
244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000170517  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
253 aa  251  6e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
253 aa  251  6e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.48 
 
 
247 aa  250  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.06 
 
 
249 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.63 
 
 
249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  47.66 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  48.54 
 
 
263 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  46.27 
 
 
256 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.61 
 
 
248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.21 
 
 
249 aa  241  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.52 
 
 
251 aa  241  7e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  48.72 
 
 
247 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.63 
 
 
259 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.95 
 
 
267 aa  238  8e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.51 
 
 
249 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
247 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  47.68 
 
 
266 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
251 aa  236  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  43.87 
 
 
254 aa  236  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.09 
 
 
249 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.86 
 
 
249 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  47.66 
 
 
249 aa  236  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  46.72 
 
 
246 aa  235  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  48.32 
 
 
240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  48.92 
 
 
240 aa  235  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  45.2 
 
 
267 aa  234  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  48.31 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.77 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
232 aa  233  3e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  45.41 
 
 
236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  47.64 
 
 
247 aa  232  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  47.68 
 
 
236 aa  231  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  44.12 
 
 
245 aa  231  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  47.21 
 
 
240 aa  231  7.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  45.85 
 
 
236 aa  231  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
244 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  46.12 
 
 
254 aa  230  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  48.1 
 
 
236 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  49.35 
 
 
248 aa  230  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  48.71 
 
 
231 aa  231  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.16 
 
 
245 aa  230  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  45.69 
 
 
255 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.22 
 
 
259 aa  229  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  45.69 
 
 
241 aa  229  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.42 
 
 
249 aa  228  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  44.17 
 
 
253 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0265  undecaprenyl diphosphate synthase  44.16 
 
 
312 aa  226  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  41.83 
 
 
255 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.5 
 
 
252 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  44.96 
 
 
257 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.03 
 
 
260 aa  225  4e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.46 
 
 
256 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.86 
 
 
241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.16 
 
 
252 aa  224  7e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.09 
 
 
252 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.58 
 
 
248 aa  224  8e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  42.57 
 
 
272 aa  224  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.49 
 
 
246 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  47.44 
 
 
234 aa  224  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  43.88 
 
 
260 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  45.8 
 
 
246 aa  224  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  46.93 
 
 
259 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  44.35 
 
 
264 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  46.93 
 
 
259 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.85 
 
 
255 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  43.17 
 
 
289 aa  223  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.17 
 
 
249 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.44 
 
 
256 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  43.88 
 
 
261 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.7 
 
 
252 aa  222  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1526  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.58 
 
 
250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00254317  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 
260 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 
260 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 
260 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 
260 aa  221  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.44 
 
 
251 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>