More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1051 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
253 aa  529  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  62.96 
 
 
245 aa  339  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  60 
 
 
246 aa  317  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4387  undecaprenyl diphosphate synthase  57.49 
 
 
250 aa  311  5.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  56.5 
 
 
260 aa  301  7.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  55.37 
 
 
276 aa  299  3e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  55.65 
 
 
272 aa  298  5e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  52.07 
 
 
276 aa  296  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  56.78 
 
 
285 aa  291  9e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  58.08 
 
 
273 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.08 
 
 
282 aa  289  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  53.25 
 
 
246 aa  285  4e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  52.3 
 
 
288 aa  283  1.0000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  54.01 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.33 
 
 
249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  54.47 
 
 
291 aa  281  6.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.19 
 
 
256 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.92 
 
 
249 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.7 
 
 
258 aa  277  1e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  54.81 
 
 
240 aa  275  4e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.17 
 
 
251 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.47 
 
 
246 aa  268  7e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.19 
 
 
246 aa  267  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.5 
 
 
246 aa  267  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.43 
 
 
249 aa  266  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  49.15 
 
 
252 aa  265  7e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  52.52 
 
 
263 aa  260  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0190  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.94 
 
 
254 aa  259  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.763759 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.42 
 
 
259 aa  259  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  51.45 
 
 
248 aa  258  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.85 
 
 
252 aa  258  7e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.06 
 
 
257 aa  257  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.54 
 
 
249 aa  256  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  51.68 
 
 
251 aa  255  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  53.19 
 
 
247 aa  254  6e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.19 
 
 
258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  47.39 
 
 
257 aa  253  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.19 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.19 
 
 
258 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.19 
 
 
258 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  50.84 
 
 
256 aa  252  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.19 
 
 
258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.19 
 
 
258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.19 
 
 
258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.19 
 
 
258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  48.76 
 
 
262 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.19 
 
 
258 aa  251  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.48 
 
 
249 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.36 
 
 
251 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.76 
 
 
257 aa  250  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  50.84 
 
 
266 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.21 
 
 
258 aa  249  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.66 
 
 
247 aa  249  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
251 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
261 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
251 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
251 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  48.51 
 
 
256 aa  249  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
251 aa  248  5e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.76 
 
 
248 aa  248  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
251 aa  248  7e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.32 
 
 
258 aa  247  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.95 
 
 
257 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.42 
 
 
254 aa  247  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  46.99 
 
 
254 aa  246  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
254 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
246 aa  245  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  47.03 
 
 
271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  51.08 
 
 
254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.79 
 
 
251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
248 aa  245  6e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0486  undecaprenyl diphosphate synthase  49.58 
 
 
294 aa  245  6e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.407745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.79 
 
 
251 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
251 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  49.36 
 
 
251 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.92 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.06 
 
 
243 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.44 
 
 
249 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  47.13 
 
 
260 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.9 
 
 
241 aa  243  3e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  46.64 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  49.13 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  46.64 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  46.64 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.03 
 
 
249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  46.44 
 
 
259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  46.64 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.32 
 
 
258 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.1 
 
 
255 aa  241  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.08 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  51.05 
 
 
250 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1282  undecaprenyl diphosphate synthase  47.72 
 
 
258 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.222938 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  45.99 
 
 
263 aa  239  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3430  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.72 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00762584  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1071  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.72 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00176842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>