More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1960 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 273 aa  554  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  55.91 
 
 		 276 aa  308  6.999999999999999e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  59.09 
 
 		 285 aa  302  5.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.87 
 
 		 282 aa  301  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  55.86 
 
 		 291 aa  301  8.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  54.26 
 
 		 282 aa  301  9e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  56.2 
 
 		 272 aa  298  5e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  59.39 
 
 		 245 aa  295  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  57.83 
 
 		 246 aa  294  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  55.56 
 
 		 276 aa  292  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  58.44 
 
 		 260 aa  292  5e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  58.08 
 
 		 253 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  55.22 
 
 		 288 aa  285  5e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4387  undecaprenyl diphosphate synthase  55.46 
 
 		 250 aa  279  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.28 
 
 		 249 aa  271  7e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.6 
 
 		 249 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.02 
 
 		 246 aa  269  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.73 
 
 		 259 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  55.79 
 
 		 264 aa  266  4e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  52.16 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  54.78 
 
 		 266 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  53.06 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.99 
 
 		 256 aa  258  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.5 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  53.51 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.4 
 
 		 246 aa  255  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  52.12 
 
 		 257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  53.68 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 		 249 aa  251  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.24 
 
 		 251 aa  251  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  52.84 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  52.84 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  52.84 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.13 
 
 		 249 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  52.4 
 
 		 260 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  52.4 
 
 		 260 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  52.4 
 
 		 260 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  52.4 
 
 		 260 aa  248  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 		 251 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 		 249 aa  248  8e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.71 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.7 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.97 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.97 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  53.48 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.5 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  52.59 
 
 		 260 aa  244  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  52.59 
 
 		 260 aa  244  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0190  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.53 
 
 		 254 aa  244  9e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.763759 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 		 257 aa  244  9e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  49.39 
 
 		 263 aa  244  9e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  50.44 
 
 		 256 aa  244  9e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  47.98 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.13 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.39 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  52.56 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  47.7 
 
 		 251 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  48.5 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  52.81 
 
 		 260 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 		 244 aa  243  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.03 
 
 		 258 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.03 
 
 		 258 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.28 
 
 		 251 aa  241  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  51.72 
 
 		 260 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.38 
 
 		 260 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  51.72 
 
 		 260 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.39 
 
 		 248 aa  241  9e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  51.72 
 
 		 260 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.72 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  51.29 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  48.26 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.63 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.63 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 		 234 aa  240  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.63 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.63 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.63 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.34 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.84 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.15 
 
 		 238 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.84 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.86 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.39 
 
 		 253 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.39 
 
 		 253 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  48.47 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.45 
 
 		 257 aa  238  5.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.84 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.78 
 
 		 256 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.84 
 
 		 251 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  53.45 
 
 		 257 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.95 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.3 
 
 		 238 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  47.88 
 
 		 265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.58 
 
 		 258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>