More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1782 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
248 aa  507  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.37 
 
 
246 aa  259  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  51.45 
 
 
253 aa  258  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.07 
 
 
251 aa  256  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  50.85 
 
 
276 aa  256  3e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.36 
 
 
256 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  47.92 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.97 
 
 
246 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.59 
 
 
249 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  48.96 
 
 
260 aa  250  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  51.06 
 
 
247 aa  250  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
245 aa  249  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  48.32 
 
 
285 aa  248  7e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  46.91 
 
 
246 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.17 
 
 
249 aa  247  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.66 
 
 
249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
256 aa  244  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  47.26 
 
 
266 aa  244  8e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  48.12 
 
 
240 aa  243  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  50.42 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  52.56 
 
 
273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  47.03 
 
 
282 aa  242  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.07 
 
 
246 aa  241  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  46.38 
 
 
276 aa  241  7.999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.68 
 
 
249 aa  241  7.999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  47.23 
 
 
291 aa  240  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.07 
 
 
251 aa  239  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.86 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  50.87 
 
 
233 aa  238  8e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.21 
 
 
252 aa  236  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  44.68 
 
 
288 aa  235  4e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  46.61 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.23 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  48.32 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.86 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
253 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
253 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.59 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  46.19 
 
 
272 aa  231  6e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  45.96 
 
 
249 aa  231  6e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.93 
 
 
259 aa  231  7.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.06 
 
 
258 aa  231  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  48.56 
 
 
254 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  48.7 
 
 
234 aa  229  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.57 
 
 
251 aa  228  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.57 
 
 
251 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.3 
 
 
249 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  49.56 
 
 
264 aa  227  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
238 aa  227  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.95 
 
 
267 aa  227  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.3 
 
 
249 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.83 
 
 
267 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  47.92 
 
 
254 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.78 
 
 
244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  44.92 
 
 
252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
247 aa  224  7e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.34 
 
 
243 aa  225  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.47 
 
 
256 aa  224  8e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  42.98 
 
 
248 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.22 
 
 
246 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  45.45 
 
 
254 aa  223  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4387  undecaprenyl diphosphate synthase  45.45 
 
 
250 aa  223  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  45.22 
 
 
236 aa  223  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.91 
 
 
233 aa  223  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.36 
 
 
253 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
257 aa  222  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  48.7 
 
 
250 aa  222  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0265  undecaprenyl diphosphate synthase  47.58 
 
 
312 aa  222  4e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45.19 
 
 
252 aa  222  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
236 aa  222  4e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  45.96 
 
 
261 aa  221  6e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.01 
 
 
275 aa  221  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  48.9 
 
 
243 aa  221  9e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  46.34 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  47.01 
 
 
275 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  44.92 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  47.7 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  44.63 
 
 
248 aa  220  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.74 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.12 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  45.57 
 
 
271 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.01 
 
 
275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.01 
 
 
275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.21 
 
 
238 aa  219  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.36 
 
 
243 aa  219  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.44 
 
 
252 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  48.54 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3585  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.28 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1274  undecaprenyl diphosphate synthase  45.57 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.278229  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.46 
 
 
252 aa  218  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.95 
 
 
247 aa  218  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  47.86 
 
 
251 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  47.86 
 
 
251 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  47.86 
 
 
251 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.21 
 
 
238 aa  218  7e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0486  undecaprenyl diphosphate synthase  47.68 
 
 
294 aa  218  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.407745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.01 
 
 
251 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  45.3 
 
 
244 aa  218  8.999999999999998e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  45.99 
 
 
266 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>