More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1193 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
238 aa  493  9.999999999999999e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.34 
 
 
259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.58 
 
 
251 aa  251  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.68 
 
 
253 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.68 
 
 
253 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
246 aa  249  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  53.1 
 
 
254 aa  249  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.27 
 
 
246 aa  248  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
240 aa  247  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.31 
 
 
256 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.81 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.94 
 
 
249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
238 aa  240  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.86 
 
 
246 aa  240  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.13 
 
 
257 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  47.68 
 
 
244 aa  239  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.46 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  50.64 
 
 
264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  47.23 
 
 
249 aa  238  5e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.88 
 
 
249 aa  238  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
252 aa  238  5e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.19 
 
 
238 aa  238  9e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  48.51 
 
 
257 aa  238  9e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.68 
 
 
249 aa  237  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.15 
 
 
258 aa  237  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  47.88 
 
 
266 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.28 
 
 
249 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.48 
 
 
249 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  47.39 
 
 
253 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.03 
 
 
246 aa  235  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.48 
 
 
249 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.5 
 
 
246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  48.91 
 
 
251 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  47.64 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.41 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  48.92 
 
 
247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  47.46 
 
 
263 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.38 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.28 
 
 
251 aa  231  5e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  47.9 
 
 
254 aa  231  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.44 
 
 
256 aa  231  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.44 
 
 
256 aa  231  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.49 
 
 
258 aa  230  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  47.06 
 
 
248 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.11 
 
 
258 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.11 
 
 
258 aa  229  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.11 
 
 
258 aa  229  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.11 
 
 
258 aa  229  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.11 
 
 
258 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  47.03 
 
 
260 aa  230  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.11 
 
 
258 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.11 
 
 
258 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.11 
 
 
267 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.11 
 
 
258 aa  229  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  45.96 
 
 
259 aa  229  3e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.11 
 
 
258 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.11 
 
 
257 aa  229  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  45.89 
 
 
246 aa  228  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  51.09 
 
 
254 aa  228  9e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
260 aa  227  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.05 
 
 
265 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
248 aa  227  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0190  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.25 
 
 
254 aa  226  2e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.763759 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  46.72 
 
 
262 aa  226  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  46.29 
 
 
272 aa  226  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  44.59 
 
 
240 aa  226  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
266 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
273 aa  226  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  47.16 
 
 
252 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  45.92 
 
 
236 aa  225  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  44.3 
 
 
276 aa  225  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  51.75 
 
 
255 aa  225  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.81 
 
 
255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  45.92 
 
 
236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.47 
 
 
237 aa  224  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
260 aa  224  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.35 
 
 
267 aa  224  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  42.13 
 
 
288 aa  224  7e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.68 
 
 
260 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.19 
 
 
267 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  48.26 
 
 
255 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  45.06 
 
 
263 aa  223  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  48.26 
 
 
250 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  48.25 
 
 
253 aa  223  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
234 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0265  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
312 aa  222  4e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.48 
 
 
260 aa  221  4.9999999999999996e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.060942  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  47.16 
 
 
254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.66 
 
 
252 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.66 
 
 
253 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.66 
 
 
253 aa  221  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  47.66 
 
 
253 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.96 
 
 
249 aa  221  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.66 
 
 
253 aa  221  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.66 
 
 
253 aa  221  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.66 
 
 
252 aa  221  8e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.18 
 
 
267 aa  221  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  45.49 
 
 
252 aa  221  8e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>