More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0190 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0190  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
254 aa  521  1e-147  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.763759 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  53.75 
 
 
272 aa  273  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  55.98 
 
 
245 aa  273  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  51.68 
 
 
261 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  52.94 
 
 
253 aa  268  7e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  54.27 
 
 
246 aa  266  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.5 
 
 
282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  51.25 
 
 
282 aa  265  4e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  48.96 
 
 
276 aa  265  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
276 aa  263  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  50.62 
 
 
291 aa  258  9e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  47.77 
 
 
252 aa  257  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4387  undecaprenyl diphosphate synthase  52.77 
 
 
250 aa  256  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  51.45 
 
 
260 aa  255  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.48 
 
 
251 aa  255  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.45 
 
 
260 aa  254  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  49.79 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  52.34 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.42 
 
 
256 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.21 
 
 
246 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.15 
 
 
251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.86 
 
 
261 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  51.53 
 
 
273 aa  250  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.21 
 
 
258 aa  249  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
262 aa  249  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.15 
 
 
256 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  51.06 
 
 
260 aa  249  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
255 aa  248  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  47.3 
 
 
256 aa  247  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  49.38 
 
 
260 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  49.38 
 
 
260 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  48.03 
 
 
288 aa  248  1e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  50.44 
 
 
256 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  48.77 
 
 
251 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  47.88 
 
 
256 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  48.96 
 
 
260 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  48.96 
 
 
260 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  48.96 
 
 
260 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  48.96 
 
 
260 aa  245  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.96 
 
 
260 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.88 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  50.88 
 
 
252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  48.36 
 
 
251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.88 
 
 
252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.88 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.88 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.88 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.88 
 
 
252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.88 
 
 
252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  50.88 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.06 
 
 
249 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
257 aa  244  9e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.66 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  49.17 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  48.13 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  47.44 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.85 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.15 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.93 
 
 
251 aa  241  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
260 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
260 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
260 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.15 
 
 
260 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  47.21 
 
 
261 aa  240  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  49.56 
 
 
263 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  48.72 
 
 
240 aa  240  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
249 aa  239  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.25 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.25 
 
 
253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.52 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38950  undecaprenyl diphosphate synthase  48.36 
 
 
251 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.522438  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  49.13 
 
 
252 aa  238  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
266 aa  238  5.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  46.89 
 
 
264 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  48.51 
 
 
257 aa  238  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  48.09 
 
 
260 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2174  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
255 aa  238  9e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  49.56 
 
 
266 aa  238  9e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  45.92 
 
 
254 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
257 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3430  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.26 
 
 
252 aa  237  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00762584  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.49 
 
 
247 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.72 
 
 
251 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1071  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.26 
 
 
252 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00176842  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1018  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.26 
 
 
252 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000425553  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  45.87 
 
 
268 aa  236  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  48.1 
 
 
247 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.32 
 
 
259 aa  236  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  47.83 
 
 
253 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  48.31 
 
 
265 aa  236  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.28 
 
 
252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  47.06 
 
 
266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0486  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
294 aa  235  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.407745 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  48.26 
 
 
253 aa  234  7e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>