More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0914 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
249 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  87.95 
 
 
249 aa  462  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  77.11 
 
 
249 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  76.71 
 
 
249 aa  407  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  75.9 
 
 
249 aa  401  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  73.98 
 
 
248 aa  400  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  73.09 
 
 
249 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  69.35 
 
 
251 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.85 
 
 
246 aa  343  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.66 
 
 
260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.85 
 
 
256 aa  301  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.45 
 
 
256 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.67 
 
 
260 aa  295  4e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.060942  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.42 
 
 
267 aa  295  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.08 
 
 
265 aa  295  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.97 
 
 
259 aa  293  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.7 
 
 
267 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.16 
 
 
266 aa  291  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.45 
 
 
267 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.67 
 
 
267 aa  278  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  54.08 
 
 
256 aa  276  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  51.74 
 
 
245 aa  270  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.51 
 
 
259 aa  270  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  52.72 
 
 
264 aa  269  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.6 
 
 
257 aa  262  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  50.87 
 
 
276 aa  262  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  51.32 
 
 
257 aa  261  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
266 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
246 aa  260  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.19 
 
 
282 aa  259  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.55 
 
 
249 aa  258  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.32 
 
 
241 aa  258  7e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.57 
 
 
247 aa  258  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88710  predicted protein  49.59 
 
 
273 aa  258  9e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0116194  decreased coverage  0.00230003 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  51.04 
 
 
259 aa  257  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
256 aa  257  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
276 aa  256  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  51.72 
 
 
251 aa  255  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
259 aa  254  7e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  46.52 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  48.1 
 
 
252 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
258 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  49.13 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.53 
 
 
258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.07 
 
 
249 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  50.87 
 
 
285 aa  250  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  51.1 
 
 
253 aa  250  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
273 aa  250  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  47.86 
 
 
263 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  47.52 
 
 
254 aa  250  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.21 
 
 
249 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  47.04 
 
 
289 aa  249  3e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.54 
 
 
250 aa  249  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  48.1 
 
 
246 aa  248  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  46.52 
 
 
282 aa  248  6e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
238 aa  248  7e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  48.61 
 
 
266 aa  248  7e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
240 aa  247  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.57 
 
 
252 aa  247  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
267 aa  247  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  45.27 
 
 
248 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  47.83 
 
 
254 aa  246  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  49.56 
 
 
251 aa  246  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
240 aa  246  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  48.32 
 
 
261 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.29 
 
 
249 aa  246  3e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  46.5 
 
 
275 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.7 
 
 
256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.5 
 
 
275 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.07 
 
 
257 aa  244  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  48.25 
 
 
272 aa  245  6e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.5 
 
 
275 aa  245  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.5 
 
 
275 aa  245  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  49.56 
 
 
234 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.52 
 
 
238 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.09 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  46.96 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  45.08 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  45.9 
 
 
275 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  45.9 
 
 
275 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  48.07 
 
 
252 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  45.9 
 
 
275 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.44 
 
 
253 aa  241  6e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.44 
 
 
253 aa  241  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  50.44 
 
 
253 aa  241  6e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.44 
 
 
253 aa  241  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.44 
 
 
253 aa  241  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  50.44 
 
 
252 aa  241  7e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.44 
 
 
252 aa  241  7e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.44 
 
 
252 aa  241  7e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  46.52 
 
 
257 aa  241  7e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
246 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  45.49 
 
 
275 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.81 
 
 
246 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  46.72 
 
 
275 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  47.68 
 
 
248 aa  241  7.999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
252 aa  241  9e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  43.82 
 
 
263 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>