More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1668 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
253 aa  521  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
253 aa  521  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  55.51 
 
 
248 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  55.6 
 
 
263 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  58.19 
 
 
266 aa  292  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.42 
 
 
249 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.42 
 
 
259 aa  289  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.5 
 
 
252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  52.99 
 
 
257 aa  285  7e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  55.07 
 
 
240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.81 
 
 
258 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.81 
 
 
258 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.81 
 
 
258 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.81 
 
 
258 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.81 
 
 
258 aa  279  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.41 
 
 
258 aa  278  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.41 
 
 
258 aa  278  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.07 
 
 
246 aa  278  8e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.93 
 
 
256 aa  277  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  47.2 
 
 
252 aa  276  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  49 
 
 
256 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.78 
 
 
258 aa  276  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
246 aa  276  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  54.31 
 
 
236 aa  275  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.81 
 
 
257 aa  274  8e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.81 
 
 
258 aa  275  8e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0979  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.98 
 
 
254 aa  273  1.0000000000000001e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00602167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  53.25 
 
 
251 aa  272  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  52.38 
 
 
240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  53.45 
 
 
236 aa  272  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  48.59 
 
 
285 aa  271  6e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  50.65 
 
 
246 aa  271  7e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.91 
 
 
258 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  50.42 
 
 
241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  53.25 
 
 
247 aa  268  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.19 
 
 
249 aa  268  8e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
258 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  48.99 
 
 
264 aa  268  8.999999999999999e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  53.25 
 
 
247 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  52.14 
 
 
234 aa  267  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.25 
 
 
258 aa  266  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.14 
 
 
267 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  53.65 
 
 
260 aa  265  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  53.25 
 
 
246 aa  264  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.39 
 
 
250 aa  263  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
257 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.28 
 
 
267 aa  262  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.44 
 
 
249 aa  262  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  48.05 
 
 
251 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  50.85 
 
 
247 aa  261  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  52.19 
 
 
245 aa  261  8e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.43 
 
 
247 aa  261  8.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  53.22 
 
 
239 aa  260  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
249 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
254 aa  259  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
246 aa  258  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  47.6 
 
 
282 aa  258  8e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0690  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.81 
 
 
270 aa  258  9e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000341789  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
249 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
249 aa  258  9e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.02 
 
 
267 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.91 
 
 
256 aa  257  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.91 
 
 
256 aa  257  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2592  undecaprenyl diphosphate synthase  53.14 
 
 
238 aa  256  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.427666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  51.32 
 
 
244 aa  256  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.72 
 
 
267 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  48.91 
 
 
276 aa  255  5e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  50.87 
 
 
232 aa  255  6e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  52.38 
 
 
254 aa  255  6e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.74 
 
 
255 aa  254  9e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  47.41 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.56 
 
 
259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.43 
 
 
267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  46.25 
 
 
259 aa  253  3e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.64 
 
 
251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
256 aa  251  6e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  45.16 
 
 
272 aa  251  7e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.6 
 
 
249 aa  251  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.43 
 
 
259 aa  251  7e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.66 
 
 
237 aa  251  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  47.39 
 
 
249 aa  251  9.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  47.37 
 
 
276 aa  251  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.3 
 
 
254 aa  250  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  48.75 
 
 
244 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.92 
 
 
243 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.3 
 
 
254 aa  250  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.28 
 
 
248 aa  250  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1945  undecaprenyl diphosphate synthase  46.72 
 
 
231 aa  251  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.77987 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.05 
 
 
260 aa  249  3e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  47.68 
 
 
238 aa  249  3e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.78 
 
 
248 aa  249  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  46.15 
 
 
264 aa  248  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
252 aa  248  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
261 aa  248  7e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  48.47 
 
 
262 aa  248  7e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
246 aa  248  8e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0805  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.61 
 
 
239 aa  247  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655328  hitchhiker  0.0000000226437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>