More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2432 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
248 aa  519  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  73.98 
 
 
249 aa  400  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  75.72 
 
 
249 aa  397  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  75.31 
 
 
249 aa  397  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  72.06 
 
 
249 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  73.14 
 
 
249 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  69.26 
 
 
249 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  67.77 
 
 
251 aa  359  2e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.51 
 
 
246 aa  332  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.08 
 
 
260 aa  300  1e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.67 
 
 
260 aa  300  2e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.060942  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.66 
 
 
265 aa  295  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.9 
 
 
256 aa  291  8e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.9 
 
 
256 aa  290  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.77 
 
 
259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.77 
 
 
266 aa  281  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.87 
 
 
267 aa  281  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.72 
 
 
267 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.62 
 
 
267 aa  275  7e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  52.72 
 
 
256 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.07 
 
 
267 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  51.91 
 
 
264 aa  262  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  51.06 
 
 
257 aa  259  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  47.18 
 
 
247 aa  255  5e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.81 
 
 
259 aa  253  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.05 
 
 
238 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  46.89 
 
 
266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
238 aa  251  6e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  48.31 
 
 
259 aa  251  9.000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
256 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.28 
 
 
253 aa  250  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.28 
 
 
253 aa  250  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
266 aa  249  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.5 
 
 
249 aa  248  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.51 
 
 
251 aa  247  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.75 
 
 
257 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  48.03 
 
 
254 aa  246  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.72 
 
 
249 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
234 aa  246  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  47.06 
 
 
248 aa  245  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  47.21 
 
 
252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  48.47 
 
 
276 aa  245  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.64 
 
 
249 aa  245  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  47.23 
 
 
246 aa  244  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  47.97 
 
 
259 aa  244  9e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.86 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  45.3 
 
 
245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  47.39 
 
 
273 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  44.9 
 
 
263 aa  240  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
253 aa  240  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
251 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  46.29 
 
 
276 aa  239  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.86 
 
 
246 aa  239  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.21 
 
 
267 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.03 
 
 
252 aa  239  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88710  predicted protein  44.67 
 
 
273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0116194  decreased coverage  0.00230003 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.72 
 
 
246 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  46.27 
 
 
289 aa  239  4e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.52 
 
 
258 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.72 
 
 
282 aa  237  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  42.08 
 
 
288 aa  235  4e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  44.44 
 
 
253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.62 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.3 
 
 
258 aa  234  8e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  45.96 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  43.64 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  47.41 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  47.19 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  46.78 
 
 
257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  48.26 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  47.14 
 
 
253 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  45.19 
 
 
272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  46.93 
 
 
240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  46.75 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  46.61 
 
 
257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  43.59 
 
 
246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  43.59 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
257 aa  231  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  45.76 
 
 
254 aa  231  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  44.35 
 
 
282 aa  231  9e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  45.06 
 
 
254 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  44.77 
 
 
240 aa  230  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  46.7 
 
 
261 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.85 
 
 
256 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  45.22 
 
 
239 aa  230  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.12 
 
 
222 aa  230  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2972  undecaprenyl diphosphate synthase  47.08 
 
 
259 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.906819 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  47.15 
 
 
250 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  44.73 
 
 
261 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.16 
 
 
255 aa  228  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.92 
 
 
241 aa  228  6e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  46.93 
 
 
254 aa  227  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3833  undecaprenyl diphosphate synthase  46.25 
 
 
260 aa  227  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0123862 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
232 aa  227  1e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1541  undecaprenyl diphosphate synthase  46.05 
 
 
237 aa  226  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3430  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.96 
 
 
252 aa  226  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00762584  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1071  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.96 
 
 
252 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00176842  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.68 
 
 
256 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0612  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.05 
 
 
237 aa  226  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>