More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1402 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
222 aa  441  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  57.08 
 
 
264 aa  256  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  52.25 
 
 
234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  54.5 
 
 
231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
240 aa  246  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  54.71 
 
 
241 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.87 
 
 
259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.65 
 
 
249 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.12 
 
 
251 aa  239  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.35 
 
 
267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.34 
 
 
233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
256 aa  238  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.46 
 
 
267 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.9 
 
 
267 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  52.65 
 
 
254 aa  236  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.23 
 
 
233 aa  236  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  50.44 
 
 
266 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.23 
 
 
249 aa  234  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  46.02 
 
 
239 aa  233  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  50 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.44 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.44 
 
 
257 aa  232  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
258 aa  232  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.56 
 
 
249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.35 
 
 
247 aa  231  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0052  undecaprenyl diphosphate synthase  49.55 
 
 
231 aa  231  5e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000100505  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  51.33 
 
 
247 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
258 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
258 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
258 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
258 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
258 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
258 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
258 aa  230  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
260 aa  230  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
248 aa  230  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.56 
 
 
258 aa  230  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.79 
 
 
267 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
248 aa  230  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
249 aa  228  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
259 aa  228  8e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.44 
 
 
244 aa  228  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  50.88 
 
 
252 aa  228  8e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  47.79 
 
 
249 aa  226  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.44 
 
 
267 aa  226  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
249 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.56 
 
 
249 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.13 
 
 
238 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.58 
 
 
238 aa  225  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.44 
 
 
271 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  49.1 
 
 
236 aa  225  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  47.75 
 
 
236 aa  224  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  46.4 
 
 
228 aa  224  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.16 
 
 
259 aa  223  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  49.12 
 
 
259 aa  223  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
254 aa  223  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.81 
 
 
256 aa  222  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  50.44 
 
 
273 aa  222  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.81 
 
 
256 aa  222  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  51.1 
 
 
266 aa  222  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  46.4 
 
 
225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.46 
 
 
252 aa  221  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.02 
 
 
253 aa  221  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.02 
 
 
253 aa  221  7e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.3 
 
 
258 aa  221  7e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  46.61 
 
 
244 aa  221  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
288 aa  221  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
258 aa  221  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  45.05 
 
 
232 aa  221  8e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
249 aa  221  9e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.23 
 
 
266 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  45.98 
 
 
245 aa  220  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.44 
 
 
252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  50.67 
 
 
261 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.56 
 
 
252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0935  undecaprenyl diphosphate synthase  47.75 
 
 
238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.67 
 
 
252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.21 
 
 
282 aa  219  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  46.22 
 
 
245 aa  218  7.999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
265 aa  218  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.21 
 
 
257 aa  218  7.999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.77 
 
 
264 aa  217  8.999999999999998e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.46 
 
 
256 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.79 
 
 
252 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.89 
 
 
269 aa  217  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.46 
 
 
256 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.44 
 
 
269 aa  216  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.79 
 
 
252 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  46.88 
 
 
276 aa  216  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  47.35 
 
 
271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  51.33 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  44.2 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  48.66 
 
 
251 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.79 
 
 
264 aa  215  5e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
273 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3513  undecaprenyl diphosphate synthase  50.9 
 
 
230 aa  214  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.161078  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  48.89 
 
 
275 aa  214  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  46.46 
 
 
263 aa  214  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  48.21 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
264 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>