More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1266 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
241 aa  483  1e-135  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.78 
 
 
271 aa  278  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.34 
 
 
269 aa  275  7e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  60.17 
 
 
271 aa  271  5.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.17 
 
 
264 aa  270  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.44 
 
 
286 aa  270  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  58.01 
 
 
275 aa  269  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.74 
 
 
282 aa  266  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  63.91 
 
 
250 aa  265  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.74 
 
 
279 aa  265  5.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.34 
 
 
269 aa  264  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  60.94 
 
 
256 aa  262  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  60.17 
 
 
273 aa  261  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.14 
 
 
264 aa  258  7e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  57.58 
 
 
262 aa  257  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  59.49 
 
 
276 aa  256  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  55.84 
 
 
288 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  57.14 
 
 
261 aa  254  7e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  57.87 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  60.43 
 
 
261 aa  252  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  56.03 
 
 
299 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  58.87 
 
 
270 aa  248  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  50.83 
 
 
264 aa  248  8e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.74 
 
 
249 aa  246  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
234 aa  246  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.83 
 
 
298 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  58.74 
 
 
228 aa  246  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.83 
 
 
298 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  56.17 
 
 
264 aa  245  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.83 
 
 
298 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  51.27 
 
 
262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  58.01 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.71 
 
 
222 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  58.19 
 
 
333 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.36 
 
 
296 aa  242  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.49 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.14 
 
 
259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  56.52 
 
 
231 aa  240  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  47.86 
 
 
239 aa  240  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  55.02 
 
 
230 aa  238  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.84 
 
 
265 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  61.04 
 
 
273 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.35 
 
 
262 aa  236  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  46.25 
 
 
256 aa  235  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  44.58 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.29 
 
 
287 aa  229  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.39 
 
 
233 aa  229  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  47.92 
 
 
257 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
244 aa  228  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  51.08 
 
 
264 aa  228  9e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.26 
 
 
259 aa  227  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
247 aa  227  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
241 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  44.86 
 
 
263 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.12 
 
 
267 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.05 
 
 
233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.76 
 
 
267 aa  225  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.68 
 
 
256 aa  224  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.68 
 
 
256 aa  224  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  46.96 
 
 
240 aa  223  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  47.88 
 
 
245 aa  223  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  48.55 
 
 
252 aa  223  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.92 
 
 
252 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  43.86 
 
 
228 aa  223  3e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.87 
 
 
251 aa  223  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3513  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
230 aa  222  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.161078  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  51.52 
 
 
257 aa  222  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  44.02 
 
 
232 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  48.91 
 
 
236 aa  220  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.88 
 
 
256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  48.91 
 
 
236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  48.03 
 
 
273 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.59 
 
 
252 aa  219  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.58 
 
 
249 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  46.41 
 
 
240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  46.67 
 
 
259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.58 
 
 
249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 
246 aa  218  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
249 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.56 
 
 
252 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.51 
 
 
249 aa  218  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.03 
 
 
246 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.69 
 
 
253 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.69 
 
 
253 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  51.09 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.15 
 
 
252 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.35 
 
 
252 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.46 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.28 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  47.5 
 
 
254 aa  214  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  43.28 
 
 
248 aa  214  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.44 
 
 
258 aa  214  7e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  52.86 
 
 
254 aa  214  8e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.07 
 
 
243 aa  214  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  43.78 
 
 
245 aa  214  9e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.8 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  53.25 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  43.1 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0052  undecaprenyl diphosphate synthase  44.3 
 
 
231 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000100505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>