More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3460 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
298 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  99.66 
 
 
298 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  99.66 
 
 
298 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  75.93 
 
 
296 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  93.91 
 
 
231 aa  434  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  93.48 
 
 
230 aa  431  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  63.67 
 
 
271 aa  357  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  66.8 
 
 
276 aa  348  7e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  65.87 
 
 
264 aa  343  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.75 
 
 
279 aa  340  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  63.35 
 
 
261 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  62.35 
 
 
256 aa  334  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.45 
 
 
264 aa  330  2e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.49 
 
 
269 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  63.16 
 
 
250 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.68 
 
 
286 aa  326  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.54 
 
 
264 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  60.24 
 
 
288 aa  325  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  62 
 
 
273 aa  325  6e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  63.56 
 
 
260 aa  324  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  61.75 
 
 
262 aa  323  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  59.51 
 
 
275 aa  322  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  58.8 
 
 
262 aa  320  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.05 
 
 
259 aa  319  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.69 
 
 
282 aa  317  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.06 
 
 
271 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  65.18 
 
 
273 aa  315  5e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  57.66 
 
 
299 aa  315  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.6 
 
 
269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  64.86 
 
 
228 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  59.51 
 
 
261 aa  306  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  58.89 
 
 
270 aa  306  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  59.11 
 
 
260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  55.32 
 
 
264 aa  290  2e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  57.03 
 
 
333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.2 
 
 
262 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.4 
 
 
287 aa  281  9e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.82 
 
 
265 aa  280  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  55.83 
 
 
241 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  46.96 
 
 
564 aa  229  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.33 
 
 
252 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.87 
 
 
267 aa  221  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.3 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
252 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.74 
 
 
252 aa  219  6e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  46.58 
 
 
266 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.16 
 
 
233 aa  216  5e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  45.53 
 
 
248 aa  215  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48 
 
 
244 aa  215  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.88 
 
 
222 aa  215  9e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.61 
 
 
251 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.45 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.11 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.27 
 
 
252 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.31 
 
 
247 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.44 
 
 
267 aa  212  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  44.72 
 
 
249 aa  211  7.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.68 
 
 
266 aa  212  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.22 
 
 
238 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.78 
 
 
238 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.21 
 
 
252 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  48.25 
 
 
257 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.79 
 
 
267 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
249 aa  209  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.03 
 
 
233 aa  209  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.42 
 
 
249 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  42.8 
 
 
256 aa  209  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  45.23 
 
 
254 aa  208  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  45.24 
 
 
259 aa  208  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  43.91 
 
 
247 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.88 
 
 
246 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.37 
 
 
241 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  43.86 
 
 
264 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.85 
 
 
256 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  40 
 
 
258 aa  206  5e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  42.42 
 
 
239 aa  205  8e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  44.26 
 
 
245 aa  205  9e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.83 
 
 
252 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  42.55 
 
 
246 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.53 
 
 
249 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  44.44 
 
 
243 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  44.3 
 
 
266 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  45.58 
 
 
254 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.42 
 
 
260 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.59 
 
 
249 aa  204  2e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.7 
 
 
237 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.7 
 
 
275 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.7 
 
 
275 aa  202  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  44.3 
 
 
251 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.62 
 
 
259 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  44.1 
 
 
271 aa  202  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.7 
 
 
275 aa  202  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  42.08 
 
 
263 aa  202  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.3 
 
 
249 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  44.74 
 
 
255 aa  201  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3513  undecaprenyl diphosphate synthase  46.7 
 
 
230 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.161078  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  43.57 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  45.34 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  44.68 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>