More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1858 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
273 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  77.51 
 
 
256 aa  401  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  80.08 
 
 
276 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  71.32 
 
 
261 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  75.3 
 
 
271 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  77.78 
 
 
269 aa  395  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  82.59 
 
 
250 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  71.76 
 
 
264 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  72.87 
 
 
271 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  71.32 
 
 
279 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  75.69 
 
 
264 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  68.82 
 
 
288 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  69.72 
 
 
275 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  73.44 
 
 
259 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  69.72 
 
 
299 aa  371  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  70.23 
 
 
262 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  70.5 
 
 
273 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  74.12 
 
 
270 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  71.8 
 
 
282 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  74.4 
 
 
261 aa  369  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  72.37 
 
 
260 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.93 
 
 
286 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  73.33 
 
 
260 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.88 
 
 
264 aa  355  5e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.08 
 
 
269 aa  352  5e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  67.87 
 
 
262 aa  351  5.9999999999999994e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  74.55 
 
 
228 aa  346  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.94 
 
 
296 aa  333  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  70.8 
 
 
333 aa  331  7.000000000000001e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.18 
 
 
298 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.18 
 
 
298 aa  329  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.18 
 
 
298 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  68.4 
 
 
265 aa  328  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.78 
 
 
287 aa  313  9.999999999999999e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  64.91 
 
 
231 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  64.91 
 
 
230 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  58.47 
 
 
264 aa  310  2e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.66 
 
 
262 aa  301  8.000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  61.04 
 
 
241 aa  271  1e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  49.4 
 
 
564 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.65 
 
 
244 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.84 
 
 
252 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.42 
 
 
252 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.98 
 
 
233 aa  224  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.64 
 
 
256 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.38 
 
 
255 aa  223  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
252 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
252 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.72 
 
 
255 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
252 aa  222  4e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  48.37 
 
 
266 aa  222  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.12 
 
 
222 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.53 
 
 
259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  44.59 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
251 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  49.35 
 
 
264 aa  219  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  48.33 
 
 
254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.22 
 
 
249 aa  219  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  50.42 
 
 
254 aa  219  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.06 
 
 
267 aa  218  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  48.58 
 
 
243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  44.54 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  46.75 
 
 
247 aa  216  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
233 aa  215  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  48.58 
 
 
255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.91 
 
 
238 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.41 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.93 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.38 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  42.55 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.61 
 
 
249 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.91 
 
 
245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  45.22 
 
 
239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.04 
 
 
238 aa  211  7e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.3 
 
 
267 aa  211  7e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
254 aa  211  7.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.09 
 
 
252 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.57 
 
 
267 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  43.86 
 
 
272 aa  210  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
249 aa  209  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 
246 aa  209  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  43.97 
 
 
266 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.15 
 
 
249 aa  209  5e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
249 aa  208  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.38 
 
 
249 aa  208  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.22 
 
 
253 aa  208  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.22 
 
 
253 aa  208  8e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  41.98 
 
 
264 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  43.4 
 
 
256 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.74 
 
 
247 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  42.61 
 
 
240 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.38 
 
 
249 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  39.76 
 
 
263 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.63 
 
 
260 aa  204  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.26 
 
 
248 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.98 
 
 
243 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3513  undecaprenyl diphosphate synthase  46.93 
 
 
230 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.161078  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.44 
 
 
248 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>