More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0451 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  100 
 
 
264 aa  546  1e-155  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  87.4 
 
 
262 aa  488  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  59.68 
 
 
288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  57.43 
 
 
261 aa  311  5.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.18 
 
 
279 aa  311  7.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  57.89 
 
 
256 aa  310  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  54.58 
 
 
275 aa  307  9e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  58.4 
 
 
299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.17 
 
 
286 aa  306  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.22 
 
 
264 aa  305  6e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  55.56 
 
 
261 aa  304  7e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  60.08 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  56.22 
 
 
271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56 
 
 
269 aa  300  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.14 
 
 
271 aa  299  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.89 
 
 
269 aa  298  6e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  57.43 
 
 
273 aa  297  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.67 
 
 
296 aa  296  3e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  55.16 
 
 
262 aa  294  8e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.98 
 
 
282 aa  294  9e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.3 
 
 
259 aa  294  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  57.83 
 
 
276 aa  293  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.44 
 
 
264 aa  291  7e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  57.83 
 
 
264 aa  291  9e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  56.52 
 
 
260 aa  290  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  57.78 
 
 
228 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  56.4 
 
 
260 aa  285  7e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  57.6 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  58.47 
 
 
273 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  57.14 
 
 
333 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.32 
 
 
298 aa  278  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.32 
 
 
298 aa  278  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.32 
 
 
298 aa  278  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  56.14 
 
 
230 aa  276  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.73 
 
 
265 aa  275  7e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  57.32 
 
 
250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  55.26 
 
 
231 aa  271  9e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.84 
 
 
287 aa  256  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  50.83 
 
 
241 aa  248  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.35 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  47.19 
 
 
239 aa  222  4e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  43.62 
 
 
564 aa  221  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.52 
 
 
252 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  43.1 
 
 
247 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.65 
 
 
252 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  42.67 
 
 
247 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.3 
 
 
249 aa  214  8e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.94 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.13 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.35 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.86 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.16 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.64 
 
 
252 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.37 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.06 
 
 
252 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.92 
 
 
247 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  45.06 
 
 
255 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.4 
 
 
251 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.08 
 
 
250 aa  207  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  43.4 
 
 
248 aa  205  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.13 
 
 
222 aa  204  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.63 
 
 
244 aa  204  9e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  39.75 
 
 
249 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.16 
 
 
233 aa  204  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  41.39 
 
 
254 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  42.86 
 
 
231 aa  203  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.8 
 
 
249 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.95 
 
 
249 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  42.92 
 
 
266 aa  203  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  43.1 
 
 
245 aa  203  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.19 
 
 
259 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  41.2 
 
 
257 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.44 
 
 
257 aa  201  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.44 
 
 
258 aa  201  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  41.91 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  42.42 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.68 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.44 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.68 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.02 
 
 
258 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.02 
 
 
258 aa  199  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.02 
 
 
258 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.02 
 
 
258 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.02 
 
 
258 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.02 
 
 
258 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.02 
 
 
258 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.67 
 
 
253 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.67 
 
 
253 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  45 
 
 
259 aa  199  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.44 
 
 
258 aa  198  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.95 
 
 
249 aa  198  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.54 
 
 
245 aa  198  9e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3513  undecaprenyl diphosphate synthase  43.7 
 
 
230 aa  198  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.161078  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  40.61 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.95 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  41.88 
 
 
243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.83 
 
 
258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  38.98 
 
 
246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  40.43 
 
 
234 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>