More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11790 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
264 aa  536  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  70.16 
 
 
269 aa  376  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  70.28 
 
 
275 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  70.63 
 
 
279 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  70.28 
 
 
286 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  69.72 
 
 
256 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  68.36 
 
 
262 aa  361  6e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  69.23 
 
 
271 aa  358  4e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  71.15 
 
 
269 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  67.69 
 
 
273 aa  354  8.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  70.12 
 
 
264 aa  350  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  72.47 
 
 
250 aa  350  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  66.93 
 
 
262 aa  349  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  68.92 
 
 
261 aa  349  3e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.25 
 
 
271 aa  349  3e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  70.75 
 
 
270 aa  346  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  65.25 
 
 
261 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  70.52 
 
 
260 aa  343  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  68.13 
 
 
282 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.17 
 
 
264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  61.96 
 
 
299 aa  338  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  67.06 
 
 
276 aa  334  7e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  65.23 
 
 
260 aa  333  2e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  61.39 
 
 
288 aa  332  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.01 
 
 
259 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  70.48 
 
 
228 aa  327  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.49 
 
 
287 aa  324  7e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.97 
 
 
296 aa  317  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  69.88 
 
 
273 aa  316  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.85 
 
 
298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.85 
 
 
298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.45 
 
 
298 aa  311  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  64.35 
 
 
231 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.86 
 
 
265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  65.06 
 
 
333 aa  305  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  63.91 
 
 
230 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  56.22 
 
 
264 aa  305  6e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.42 
 
 
262 aa  298  8e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  60.17 
 
 
241 aa  270  1e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  47.79 
 
 
564 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  52.59 
 
 
264 aa  229  5e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.41 
 
 
233 aa  227  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.6 
 
 
244 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.05 
 
 
258 aa  225  7e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  46.29 
 
 
240 aa  221  7e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.97 
 
 
247 aa  221  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.53 
 
 
249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.26 
 
 
251 aa  218  8.999999999999998e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  46.03 
 
 
262 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  46.22 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  45.34 
 
 
249 aa  216  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  48.33 
 
 
254 aa  216  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  46.22 
 
 
266 aa  215  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.03 
 
 
233 aa  215  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.79 
 
 
222 aa  215  7e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.85 
 
 
259 aa  215  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.03 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  42.49 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  44.83 
 
 
240 aa  214  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.61 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.92 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  48.47 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  48.47 
 
 
247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.98 
 
 
252 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  45.45 
 
 
243 aa  211  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.15 
 
 
249 aa  211  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  41.95 
 
 
248 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  48.48 
 
 
252 aa  209  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.55 
 
 
252 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  48.47 
 
 
257 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.83 
 
 
253 aa  208  9e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.83 
 
 
253 aa  208  9e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  41.08 
 
 
246 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  41.2 
 
 
275 aa  206  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.49 
 
 
249 aa  206  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.75 
 
 
252 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.55 
 
 
275 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.74 
 
 
255 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.91 
 
 
238 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  46.64 
 
 
255 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  42.8 
 
 
257 aa  206  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  46.03 
 
 
266 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  40.74 
 
 
264 aa  205  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.37 
 
 
252 aa  206  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.61 
 
 
249 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.48 
 
 
238 aa  205  6e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  44.78 
 
 
263 aa  205  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.55 
 
 
275 aa  205  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.55 
 
 
275 aa  205  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  44.92 
 
 
259 aa  205  6e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  43.1 
 
 
291 aa  204  9e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
252 aa  204  9e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.41 
 
 
241 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3513  undecaprenyl diphosphate synthase  47.37 
 
 
230 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.161078  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.86 
 
 
256 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.64 
 
 
248 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.46 
 
 
252 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  40.23 
 
 
275 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>