More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3231 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
264 aa  543  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  83.53 
 
 
261 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  82.21 
 
 
282 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  75.89 
 
 
271 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  78.6 
 
 
262 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  77.48 
 
 
270 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  74.71 
 
 
273 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  76.86 
 
 
259 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  73.02 
 
 
271 aa  396  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  73.73 
 
 
256 aa  387  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  77.43 
 
 
260 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  73.73 
 
 
276 aa  384  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  72.27 
 
 
275 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  73.36 
 
 
269 aa  383  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  71.6 
 
 
286 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  72.47 
 
 
279 aa  376  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  70.12 
 
 
299 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  69.17 
 
 
288 aa  374  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  70.12 
 
 
264 aa  370  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  71.32 
 
 
261 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  70.4 
 
 
264 aa  373  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  70.93 
 
 
262 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  76 
 
 
250 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  75.69 
 
 
273 aa  364  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  73.52 
 
 
260 aa  357  9e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  69.23 
 
 
296 aa  345  4e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.87 
 
 
298 aa  338  5e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.87 
 
 
298 aa  338  5e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.82 
 
 
269 aa  338  5.9999999999999996e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.87 
 
 
298 aa  337  9e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  72.12 
 
 
228 aa  335  2.9999999999999997e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.05 
 
 
287 aa  332  4e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  67.32 
 
 
333 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  67.06 
 
 
265 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  67.1 
 
 
231 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  66.09 
 
 
230 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  57.83 
 
 
264 aa  311  5.999999999999999e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.23 
 
 
262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  56.36 
 
 
241 aa  260  2e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  47.81 
 
 
564 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  46.41 
 
 
248 aa  236  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  52.14 
 
 
264 aa  234  9e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  50.84 
 
 
266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.66 
 
 
233 aa  233  3e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.19 
 
 
244 aa  232  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.87 
 
 
252 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.4 
 
 
252 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.87 
 
 
252 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.11 
 
 
222 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.41 
 
 
252 aa  228  9e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.43 
 
 
259 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  47.16 
 
 
240 aa  226  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
254 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.47 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.47 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.44 
 
 
252 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.09 
 
 
252 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.16 
 
 
252 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.38 
 
 
255 aa  223  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.09 
 
 
233 aa  223  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  49.38 
 
 
257 aa  222  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  46.38 
 
 
263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.49 
 
 
255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.03 
 
 
249 aa  221  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.03 
 
 
249 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  45.76 
 
 
249 aa  221  7e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  47.35 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  47.28 
 
 
247 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.76 
 
 
246 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  47.6 
 
 
234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.42 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.91 
 
 
247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  46.86 
 
 
247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  47.16 
 
 
266 aa  218  6e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.11 
 
 
249 aa  217  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  44.98 
 
 
239 aa  217  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.37 
 
 
238 aa  217  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  45.73 
 
 
244 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.26 
 
 
251 aa  217  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
240 aa  217  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.37 
 
 
238 aa  216  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.31 
 
 
256 aa  217  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.58 
 
 
249 aa  216  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  44.64 
 
 
251 aa  214  9e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  46.15 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.05 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.05 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  43.98 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.56 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.59 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.47 
 
 
237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.42 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3513  undecaprenyl diphosphate synthase  49.56 
 
 
230 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.161078  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  47.6 
 
 
254 aa  212  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.79 
 
 
255 aa  212  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  42.39 
 
 
264 aa  211  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.29 
 
 
252 aa  211  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.93 
 
 
249 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>