More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3373 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  75.98 
 
 
279 aa  410  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  79.92 
 
 
261 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  73.41 
 
 
275 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  72.62 
 
 
286 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  73.33 
 
 
271 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  75.69 
 
 
260 aa  380  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  73.31 
 
 
261 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  74.5 
 
 
262 aa  378  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  78.97 
 
 
269 aa  379  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  76.83 
 
 
276 aa  374  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  72.76 
 
 
271 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  79.6 
 
 
250 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  70.56 
 
 
299 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.88 
 
 
264 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  78.95 
 
 
228 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.72 
 
 
264 aa  366  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  74.12 
 
 
282 aa  363  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  73.73 
 
 
264 aa  363  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  69.32 
 
 
288 aa  363  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.32 
 
 
269 aa  361  8e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  70.08 
 
 
273 aa  360  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  70.63 
 
 
262 aa  359  3e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  77.51 
 
 
273 aa  353  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  72.87 
 
 
259 aa  352  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  70.36 
 
 
270 aa  349  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  69.41 
 
 
260 aa  343  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.75 
 
 
287 aa  332  4e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.99 
 
 
296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  70.73 
 
 
333 aa  315  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.35 
 
 
298 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.35 
 
 
298 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.35 
 
 
298 aa  315  6e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  67.34 
 
 
265 aa  312  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  57.89 
 
 
264 aa  310  1e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.37 
 
 
262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  63.48 
 
 
231 aa  298  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  61.74 
 
 
230 aa  291  5e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  60.94 
 
 
241 aa  262  4e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
252 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  46.46 
 
 
564 aa  229  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.56 
 
 
244 aa  227  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.86 
 
 
252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
252 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
252 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  47.01 
 
 
266 aa  215  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.26 
 
 
233 aa  215  7e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.89 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.92 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.84 
 
 
251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.96 
 
 
249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  43.64 
 
 
249 aa  212  5.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  47.66 
 
 
255 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.44 
 
 
249 aa  210  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  44.54 
 
 
239 aa  210  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  45.45 
 
 
254 aa  209  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.81 
 
 
245 aa  209  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  48.03 
 
 
257 aa  208  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.81 
 
 
252 aa  208  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48 
 
 
222 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.81 
 
 
259 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.92 
 
 
267 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  42.36 
 
 
240 aa  205  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.26 
 
 
233 aa  205  6e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  44.72 
 
 
247 aa  205  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.54 
 
 
255 aa  205  7e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.57 
 
 
241 aa  204  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  46.34 
 
 
243 aa  204  8e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.54 
 
 
255 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  40.93 
 
 
248 aa  203  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  46.49 
 
 
254 aa  203  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.67 
 
 
238 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  46.75 
 
 
264 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  44.07 
 
 
247 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  43.64 
 
 
247 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.23 
 
 
238 aa  202  5e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.3 
 
 
251 aa  202  5e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.3 
 
 
249 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.3 
 
 
249 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.57 
 
 
247 aa  201  9e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  40.74 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.95 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.93 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  47.66 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.86 
 
 
256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  45.81 
 
 
259 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  45.81 
 
 
259 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.99 
 
 
237 aa  198  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  39.91 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  42.8 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.66 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.66 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  41.03 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.2 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.68 
 
 
254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  38.49 
 
 
246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  40.93 
 
 
240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2151  undecaprenyl diphosphate synthase  48.15 
 
 
245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>