More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3152 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 		 276 aa  560  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  81.85 
 
 		 271 aa  458  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  73.52 
 
 		 261 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  76.83 
 
 		 256 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  72.58 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  73.98 
 
 		 279 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  70.68 
 
 		 288 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  73.73 
 
 		 264 aa  378  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  74.12 
 
 		 269 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  71.54 
 
 		 271 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  80.08 
 
 		 273 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  76.61 
 
 		 250 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  66.92 
 
 		 275 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  69.8 
 
 		 262 aa  364  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  71.83 
 
 		 261 aa  362  4e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  67.47 
 
 		 286 aa  358  6e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  69.77 
 
 		 273 aa  357  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  70.47 
 
 		 259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  70.52 
 
 		 282 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  72.06 
 
 		 260 aa  355  3.9999999999999996e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  69.41 
 
 		 270 aa  353  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  68.65 
 
 		 262 aa  352  4e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  66.04 
 
 		 299 aa  352  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  70.16 
 
 		 296 aa  351  7e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  77.83 
 
 		 228 aa  350  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  67.06 
 
 		 264 aa  347  8e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  68.92 
 
 		 260 aa  346  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.8 
 
 		 298 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.8 
 
 		 298 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.8 
 
 		 298 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  67.07 
 
 		 269 aa  342  4e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  68.25 
 
 		 333 aa  331  9e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  67.98 
 
 		 231 aa  328  7e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  67.11 
 
 		 230 aa  324  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  67.47 
 
 		 265 aa  323  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  57.83 
 
 		 264 aa  305  4.0000000000000004e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.65 
 
 		 287 aa  300  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.03 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  60.34 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.38 
 
 		 252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.96 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.99 
 
 		 252 aa  232  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.58 
 
 		 252 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 		 252 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.79 
 
 		 252 aa  228  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.43 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  47.04 
 
 		 564 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.39 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  49.58 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.02 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.34 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.75 
 
 		 253 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.75 
 
 		 253 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.36 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.04 
 
 		 238 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  48.93 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  44.54 
 
 		 249 aa  217  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.7 
 
 		 233 aa  217  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.7 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  45.02 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.44 
 
 		 222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.37 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  46.52 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.64 
 
 		 249 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.97 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.55 
 
 		 247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.91 
 
 		 245 aa  214  9e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.04 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  48.03 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.71 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  44.68 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.96 
 
 		 249 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  45.02 
 
 		 266 aa  212  7e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  48.23 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.08 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.95 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.39 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  46.52 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.26 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 		 249 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.1 
 
 		 246 aa  209  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.75 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 		 240 aa  208  9e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  46.22 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  48.46 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  47.28 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.78 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.04 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.15 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.78 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  47.6 
 
 		 259 aa  205  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  47.6 
 
 		 259 aa  205  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  41.2 
 
 		 246 aa  205  7e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.31 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  42.06 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3513  undecaprenyl diphosphate synthase  46.93 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.161078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  39.33 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.92 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.86 
 
 		 248 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>