More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1538 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
260 aa  531  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  78.35 
 
 
279 aa  427  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  76.59 
 
 
286 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  75.4 
 
 
275 aa  410  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  75.98 
 
 
256 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  78.43 
 
 
261 aa  402  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  74.19 
 
 
261 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  70.2 
 
 
262 aa  370  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  68.11 
 
 
269 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  76.55 
 
 
228 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  68.55 
 
 
271 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  72.33 
 
 
269 aa  367  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  68.65 
 
 
271 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  72.06 
 
 
276 aa  362  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  72.94 
 
 
282 aa  363  2e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  67.95 
 
 
259 aa  359  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  73.52 
 
 
264 aa  358  5e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  68.22 
 
 
273 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  65.75 
 
 
288 aa  353  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66 
 
 
264 aa  353  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  66.67 
 
 
299 aa  353  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.23 
 
 
264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  67.72 
 
 
287 aa  351  8e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  69.41 
 
 
270 aa  349  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  69.41 
 
 
260 aa  346  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  72.37 
 
 
273 aa  347  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  74.09 
 
 
250 aa  346  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  68.11 
 
 
262 aa  344  7e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64 
 
 
296 aa  330  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  70.56 
 
 
333 aa  323  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.56 
 
 
298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.56 
 
 
298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.56 
 
 
298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  56.52 
 
 
264 aa  311  6.999999999999999e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.32 
 
 
265 aa  309  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.63 
 
 
262 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  62.61 
 
 
230 aa  300  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  62.17 
 
 
231 aa  298  7e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  60.87 
 
 
241 aa  270  1e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.97 
 
 
252 aa  242  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.05 
 
 
252 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.05 
 
 
252 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.41 
 
 
252 aa  238  8e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.97 
 
 
252 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.93 
 
 
244 aa  234  8e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.44 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
255 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  46.25 
 
 
564 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  47.52 
 
 
254 aa  226  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.61 
 
 
248 aa  225  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  48.72 
 
 
266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.92 
 
 
233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.93 
 
 
238 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.05 
 
 
238 aa  221  6e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  45.85 
 
 
243 aa  221  7e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
257 aa  221  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.22 
 
 
241 aa  220  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.66 
 
 
237 aa  220  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.59 
 
 
247 aa  219  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.61 
 
 
255 aa  218  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.84 
 
 
245 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.6 
 
 
252 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  46.72 
 
 
247 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.18 
 
 
255 aa  216  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  48.91 
 
 
264 aa  217  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  46.69 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  43.83 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46 
 
 
256 aa  214  9e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  43.46 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  45.85 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  45.41 
 
 
240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.44 
 
 
222 aa  211  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.02 
 
 
249 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.63 
 
 
249 aa  211  9e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  44.1 
 
 
239 aa  211  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  44.74 
 
 
264 aa  210  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  45.45 
 
 
266 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.85 
 
 
233 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  41.57 
 
 
275 aa  209  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  48.46 
 
 
259 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  48.46 
 
 
259 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  43.5 
 
 
264 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.93 
 
 
254 aa  209  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.93 
 
 
254 aa  209  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  41.57 
 
 
275 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  41.57 
 
 
275 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  41.57 
 
 
275 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.4 
 
 
275 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  41.57 
 
 
275 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.44 
 
 
266 aa  208  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  43.91 
 
 
263 aa  208  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.88 
 
 
249 aa  208  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  45.18 
 
 
254 aa  208  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  41.04 
 
 
275 aa  208  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.74 
 
 
267 aa  208  8e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  46.38 
 
 
254 aa  207  9e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  43.03 
 
 
256 aa  208  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  43.86 
 
 
256 aa  208  9e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.46 
 
 
249 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>