More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12387 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 
296 aa  610  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  75.93 
 
 
298 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  76.27 
 
 
298 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  76.27 
 
 
298 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  78.7 
 
 
231 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  76.96 
 
 
230 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  68.55 
 
 
271 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.87 
 
 
279 aa  358  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  69.88 
 
 
276 aa  355  5e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  66.27 
 
 
288 aa  355  6.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  66.4 
 
 
261 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  65.99 
 
 
256 aa  346  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.87 
 
 
286 aa  345  5e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  69.23 
 
 
264 aa  344  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  69.23 
 
 
250 aa  343  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.37 
 
 
264 aa  343  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  67.47 
 
 
269 aa  343  2e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  66.4 
 
 
262 aa  342  2.9999999999999997e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  65.59 
 
 
275 aa  342  4e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.11 
 
 
271 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.97 
 
 
264 aa  333  1e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  65.99 
 
 
262 aa  332  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  64.78 
 
 
273 aa  332  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.73 
 
 
282 aa  330  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  71.17 
 
 
228 aa  330  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  60.48 
 
 
299 aa  328  9e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  64 
 
 
260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.24 
 
 
269 aa  325  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.4 
 
 
259 aa  324  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  64.4 
 
 
270 aa  323  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  63.56 
 
 
261 aa  321  7e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  64 
 
 
260 aa  321  8e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  66.94 
 
 
273 aa  315  8e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  53.67 
 
 
264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.05 
 
 
262 aa  300  1e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.6 
 
 
287 aa  295  4e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  60.98 
 
 
333 aa  295  8e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.76 
 
 
265 aa  292  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  54.36 
 
 
241 aa  257  1e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.36 
 
 
252 aa  225  7e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
244 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  47.21 
 
 
564 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.91 
 
 
251 aa  221  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  47.52 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.93 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.16 
 
 
252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.93 
 
 
252 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.72 
 
 
252 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.09 
 
 
252 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.34 
 
 
249 aa  217  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.52 
 
 
233 aa  216  5e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
247 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.35 
 
 
252 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.44 
 
 
249 aa  215  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.18 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.74 
 
 
255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.64 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  47.16 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  45.85 
 
 
266 aa  212  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.05 
 
 
248 aa  212  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  45.56 
 
 
243 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.56 
 
 
222 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.66 
 
 
251 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  47.81 
 
 
247 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  47.62 
 
 
264 aa  209  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  44.74 
 
 
264 aa  209  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.03 
 
 
249 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  44.67 
 
 
256 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.18 
 
 
256 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.93 
 
 
237 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  44.67 
 
 
254 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  47.35 
 
 
254 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.26 
 
 
250 aa  207  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  43.29 
 
 
240 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  44.35 
 
 
282 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.1 
 
 
238 aa  206  5e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  40.91 
 
 
248 aa  206  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.81 
 
 
258 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
249 aa  205  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.6 
 
 
267 aa  205  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.17 
 
 
247 aa  205  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  45.85 
 
 
255 aa  205  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  49.12 
 
 
259 aa  205  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2707  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.92 
 
 
247 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  49.12 
 
 
259 aa  205  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1364  undecaprenyl diphosphate synthase  45.92 
 
 
247 aa  205  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  40.35 
 
 
268 aa  205  8e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.1 
 
 
267 aa  205  9e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.42 
 
 
256 aa  204  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  44.08 
 
 
249 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  42.74 
 
 
246 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  43.53 
 
 
234 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  43.78 
 
 
256 aa  203  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.98 
 
 
275 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  43.15 
 
 
261 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.52 
 
 
233 aa  203  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  44.3 
 
 
266 aa  203  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.67 
 
 
259 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  42.08 
 
 
263 aa  203  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>