More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13650 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
264 aa  543  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  72.91 
 
 
288 aa  401  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  72.4 
 
 
271 aa  390  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  72 
 
 
276 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  69.88 
 
 
256 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  65.62 
 
 
275 aa  361  6e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  65.77 
 
 
261 aa  361  8e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.67 
 
 
286 aa  359  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  68.13 
 
 
269 aa  358  4e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  71.76 
 
 
273 aa  355  5e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  70.4 
 
 
264 aa  354  6.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  68.36 
 
 
262 aa  353  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.8 
 
 
271 aa  352  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.06 
 
 
279 aa  349  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  65.75 
 
 
261 aa  350  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  68.42 
 
 
282 aa  348  4e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  68.55 
 
 
262 aa  346  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  64.94 
 
 
299 aa  346  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.41 
 
 
259 aa  346  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  67.06 
 
 
273 aa  343  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  68.4 
 
 
250 aa  343  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.29 
 
 
269 aa  342  2.9999999999999997e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.17 
 
 
264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  66.53 
 
 
260 aa  336  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  66 
 
 
260 aa  335  3.9999999999999995e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  66.53 
 
 
270 aa  335  3.9999999999999995e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.37 
 
 
296 aa  330  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  67.11 
 
 
228 aa  317  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.54 
 
 
298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.54 
 
 
298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.54 
 
 
298 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  60.56 
 
 
333 aa  309  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.77 
 
 
265 aa  305  6e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.16 
 
 
287 aa  304  8.000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  62.61 
 
 
231 aa  299  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  62.17 
 
 
230 aa  298  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  54.44 
 
 
264 aa  291  7e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.06 
 
 
262 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  57.14 
 
 
241 aa  258  8e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.92 
 
 
259 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
252 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.19 
 
 
252 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.34 
 
 
252 aa  221  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  45.82 
 
 
564 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.35 
 
 
244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.92 
 
 
233 aa  219  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  47.14 
 
 
254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.07 
 
 
246 aa  218  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.34 
 
 
249 aa  218  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48 
 
 
252 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.77 
 
 
222 aa  217  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  46.44 
 
 
243 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2707  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.68 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1364  undecaprenyl diphosphate synthase  47.68 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  44.98 
 
 
239 aa  216  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  44.49 
 
 
248 aa  216  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  43.64 
 
 
249 aa  216  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  42.55 
 
 
246 aa  215  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.17 
 
 
247 aa  214  8e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.35 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.27 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.07 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  44.05 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  45.06 
 
 
264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.03 
 
 
233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.31 
 
 
256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  43.28 
 
 
266 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.57 
 
 
251 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.87 
 
 
249 aa  211  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.86 
 
 
252 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  45.19 
 
 
255 aa  209  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  44.64 
 
 
247 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  43.1 
 
 
234 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.41 
 
 
253 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.41 
 
 
253 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  46.49 
 
 
257 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  43.86 
 
 
246 aa  209  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  44.3 
 
 
266 aa  209  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  47.6 
 
 
254 aa  208  8e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  44.4 
 
 
259 aa  208  8e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  42.79 
 
 
256 aa  208  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  42.11 
 
 
263 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.54 
 
 
238 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  43.4 
 
 
238 aa  206  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.78 
 
 
251 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  40.24 
 
 
264 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2151  undecaprenyl diphosphate synthase  47.26 
 
 
245 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  43.72 
 
 
252 aa  203  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.3 
 
 
261 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.13 
 
 
267 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  45.18 
 
 
254 aa  202  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  42.11 
 
 
231 aa  203  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.67 
 
 
238 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.03 
 
 
260 aa  202  4e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.84 
 
 
275 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.86 
 
 
249 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.56 
 
 
250 aa  202  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.49 
 
 
260 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.88 
 
 
243 aa  202  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>