More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0640 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
231 aa  473  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0935  undecaprenyl diphosphate synthase  53.33 
 
 
238 aa  263  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.19 
 
 
233 aa  259  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0052  undecaprenyl diphosphate synthase  52.89 
 
 
231 aa  257  9e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000100505  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.07 
 
 
233 aa  254  8e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.5 
 
 
222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.87 
 
 
247 aa  248  6e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  50.67 
 
 
228 aa  246  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  52.49 
 
 
225 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
245 aa  244  6e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  47.86 
 
 
246 aa  241  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  48.48 
 
 
247 aa  239  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  52.38 
 
 
288 aa  239  2e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
258 aa  238  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
258 aa  238  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
249 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  48.48 
 
 
266 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
258 aa  236  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
258 aa  236  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
257 aa  236  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.19 
 
 
253 aa  236  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.19 
 
 
253 aa  236  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
258 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
258 aa  236  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
258 aa  236  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
258 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
258 aa  236  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  49.14 
 
 
248 aa  235  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
258 aa  235  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  45.3 
 
 
259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.92 
 
 
249 aa  234  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
263 aa  234  8e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  46.12 
 
 
260 aa  234  8e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  47.44 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.29 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.91 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.25 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.25 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
257 aa  232  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  47.83 
 
 
246 aa  231  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.05 
 
 
246 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
256 aa  231  9e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.35 
 
 
267 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  47.37 
 
 
257 aa  229  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  46.52 
 
 
245 aa  229  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  49.56 
 
 
232 aa  230  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  46.96 
 
 
261 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  46.72 
 
 
252 aa  228  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.7 
 
 
256 aa  228  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
258 aa  227  9e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  49.12 
 
 
265 aa  228  9e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.89 
 
 
246 aa  227  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
249 aa  227  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  46.22 
 
 
241 aa  227  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  46.85 
 
 
255 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
249 aa  227  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  48.46 
 
 
240 aa  226  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
267 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45.02 
 
 
252 aa  226  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  46.32 
 
 
282 aa  226  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1541  undecaprenyl diphosphate synthase  48.25 
 
 
237 aa  226  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  47.41 
 
 
240 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0612  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.25 
 
 
237 aa  226  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204719  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.05 
 
 
246 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  46.52 
 
 
249 aa  226  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.19 
 
 
252 aa  225  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.46 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  47.6 
 
 
240 aa  225  5.0000000000000005e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.26 
 
 
265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  46.49 
 
 
288 aa  224  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  46.49 
 
 
244 aa  224  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.12 
 
 
249 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  46.58 
 
 
253 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2972  undecaprenyl diphosphate synthase  47.23 
 
 
259 aa  223  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.906819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  44.26 
 
 
260 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.19 
 
 
238 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  44.87 
 
 
259 aa  223  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.09 
 
 
249 aa  223  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45.45 
 
 
285 aa  223  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.69 
 
 
249 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1526  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.58 
 
 
250 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00254317  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.19 
 
 
249 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.84 
 
 
267 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.78 
 
 
257 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.19 
 
 
238 aa  222  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.32 
 
 
251 aa  222  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  47.14 
 
 
253 aa  222  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10910  undecaprenyl diphosphate synthase  39.77 
 
 
289 aa  222  4e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.183526  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  44.68 
 
 
260 aa  222  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  45.29 
 
 
244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.05 
 
 
256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  48.02 
 
 
261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.28 
 
 
249 aa  221  6e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  45.85 
 
 
262 aa  221  7e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.79 
 
 
252 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.41 
 
 
256 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>