More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1256 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
288 aa  585  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  72.91 
 
 
264 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  67.04 
 
 
271 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  69.32 
 
 
256 aa  364  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  68.56 
 
 
276 aa  363  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  67.47 
 
 
261 aa  361  7.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  69.05 
 
 
262 aa  361  9e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.57 
 
 
286 aa  358  4e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  61.89 
 
 
299 aa  358  6e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.6 
 
 
271 aa  358  7e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  68.22 
 
 
269 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  68.87 
 
 
264 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  62.93 
 
 
275 aa  353  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.64 
 
 
279 aa  353  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  65.4 
 
 
270 aa  349  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  67.06 
 
 
261 aa  348  5e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  64.94 
 
 
262 aa  343  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  67.66 
 
 
273 aa  343  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  65.75 
 
 
260 aa  342  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.62 
 
 
282 aa  340  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.27 
 
 
296 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  65.34 
 
 
273 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  65.49 
 
 
260 aa  333  2e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.39 
 
 
264 aa  332  3e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  67.87 
 
 
250 aa  332  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.8 
 
 
259 aa  330  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.08 
 
 
269 aa  323  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  59.68 
 
 
264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.87 
 
 
262 aa  316  3e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  63.6 
 
 
333 aa  315  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.92 
 
 
298 aa  314  9e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.92 
 
 
298 aa  314  9e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.92 
 
 
298 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  63.72 
 
 
228 aa  308  8e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60 
 
 
265 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  60.43 
 
 
231 aa  300  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.62 
 
 
287 aa  296  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  59.13 
 
 
230 aa  296  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  55.84 
 
 
241 aa  257  2e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  51 
 
 
254 aa  236  4e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.34 
 
 
244 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.95 
 
 
252 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  46.06 
 
 
564 aa  229  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.54 
 
 
252 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  46.49 
 
 
231 aa  224  9e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  45.41 
 
 
239 aa  223  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
249 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.15 
 
 
258 aa  223  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.98 
 
 
233 aa  223  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.23 
 
 
252 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.35 
 
 
259 aa  222  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  46.18 
 
 
264 aa  221  9e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
222 aa  221  9e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.83 
 
 
247 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  45.76 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.47 
 
 
253 aa  218  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.47 
 
 
253 aa  218  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.13 
 
 
252 aa  218  7e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.6 
 
 
252 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  48.25 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.5 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  44.12 
 
 
240 aa  216  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  45.9 
 
 
257 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  45.26 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  46.58 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.16 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.3 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.8 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.64 
 
 
249 aa  212  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.67 
 
 
252 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  42.74 
 
 
246 aa  212  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.7 
 
 
267 aa  212  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.6 
 
 
233 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.35 
 
 
250 aa  209  3e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  45.69 
 
 
266 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.05 
 
 
245 aa  209  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  45.23 
 
 
243 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  43.86 
 
 
246 aa  209  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.46 
 
 
237 aa  208  8e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.62 
 
 
249 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3513  undecaprenyl diphosphate synthase  47.81 
 
 
230 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.161078  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  43.61 
 
 
225 aa  208  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
259 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.86 
 
 
238 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.29 
 
 
260 aa  206  3e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  44.3 
 
 
236 aa  206  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  43.59 
 
 
266 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.92 
 
 
256 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.98 
 
 
255 aa  206  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  43.86 
 
 
236 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.92 
 
 
256 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2707  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.93 
 
 
247 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1364  undecaprenyl diphosphate synthase  46.93 
 
 
247 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  45.75 
 
 
254 aa  206  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  44.87 
 
 
255 aa  205  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.35 
 
 
251 aa  205  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  44.21 
 
 
254 aa  205  6e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  46.26 
 
 
259 aa  205  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  46.26 
 
 
259 aa  205  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  46.05 
 
 
245 aa  205  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>