More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3446 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
270 aa  550  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  94.59 
 
 
260 aa  481  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  74.32 
 
 
261 aa  413  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  79.92 
 
 
282 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  76.36 
 
 
273 aa  400  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  77.48 
 
 
264 aa  397  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  75 
 
 
271 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  74.81 
 
 
262 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  75.59 
 
 
259 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  72.55 
 
 
269 aa  378  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  70.56 
 
 
271 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.41 
 
 
279 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  70.36 
 
 
256 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  69.14 
 
 
275 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  70.75 
 
 
264 aa  368  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  78.14 
 
 
250 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  66.14 
 
 
288 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  67.05 
 
 
286 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  68.75 
 
 
262 aa  362  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  69.41 
 
 
276 aa  360  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  71.03 
 
 
261 aa  359  3e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  66.93 
 
 
299 aa  359  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.53 
 
 
264 aa  355  5.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  68.87 
 
 
260 aa  349  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  73.83 
 
 
273 aa  347  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.71 
 
 
269 aa  343  1e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  69.3 
 
 
228 aa  328  7e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.4 
 
 
296 aa  323  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  65.62 
 
 
333 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.29 
 
 
265 aa  311  7.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  57.6 
 
 
264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.5 
 
 
287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.47 
 
 
262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.29 
 
 
298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.29 
 
 
298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.89 
 
 
298 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  60 
 
 
231 aa  289  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  59.13 
 
 
230 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  58.87 
 
 
241 aa  263  2e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
564 aa  241  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  51.08 
 
 
264 aa  226  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.62 
 
 
233 aa  224  9e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.37 
 
 
252 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.52 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
254 aa  219  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  45.06 
 
 
266 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.59 
 
 
244 aa  218  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.56 
 
 
252 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.54 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.03 
 
 
233 aa  216  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
252 aa  216  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.38 
 
 
247 aa  216  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.67 
 
 
252 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.91 
 
 
252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  44.54 
 
 
240 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.76 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  42.8 
 
 
248 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.29 
 
 
259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.56 
 
 
222 aa  212  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  48.32 
 
 
243 aa  211  9e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
254 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.25 
 
 
251 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.34 
 
 
249 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.34 
 
 
249 aa  209  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  44.07 
 
 
249 aa  209  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.31 
 
 
258 aa  209  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  42.51 
 
 
263 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.13 
 
 
249 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  43.08 
 
 
254 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.1 
 
 
252 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  46 
 
 
257 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.04 
 
 
243 aa  206  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.34 
 
 
249 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  44.3 
 
 
291 aa  205  7e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.34 
 
 
249 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  43.4 
 
 
266 aa  205  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  43.83 
 
 
275 aa  205  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.46 
 
 
237 aa  204  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.16 
 
 
252 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.62 
 
 
248 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.83 
 
 
275 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.83 
 
 
275 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.53 
 
 
249 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  44.93 
 
 
240 aa  202  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.71 
 
 
260 aa  202  3e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.4 
 
 
253 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.4 
 
 
253 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  46.41 
 
 
266 aa  202  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  41.98 
 
 
264 aa  202  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.4 
 
 
275 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  43.86 
 
 
231 aa  202  5e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  41.92 
 
 
239 aa  202  5e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  44.77 
 
 
247 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.4 
 
 
255 aa  202  6e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  44.02 
 
 
256 aa  201  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  45.18 
 
 
282 aa  202  7e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  42.98 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  42.55 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  42.55 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  44.74 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>