More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2756 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
271 aa  559  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  81.85 
 
 
276 aa  438  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  72.4 
 
 
264 aa  390  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  70.92 
 
 
261 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  70 
 
 
271 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  72.76 
 
 
256 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  68.67 
 
 
288 aa  370  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  73.02 
 
 
264 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  70.45 
 
 
279 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  72.91 
 
 
269 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  70.45 
 
 
262 aa  363  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  74.19 
 
 
250 aa  362  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  70.45 
 
 
273 aa  360  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  67.19 
 
 
262 aa  358  4e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.23 
 
 
264 aa  358  4e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  66.4 
 
 
299 aa  358  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  66 
 
 
275 aa  358  6e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  75.3 
 
 
273 aa  357  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.88 
 
 
282 aa  354  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.6 
 
 
286 aa  353  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  70.85 
 
 
270 aa  353  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  68.53 
 
 
259 aa  348  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  68.55 
 
 
296 aa  347  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  70.04 
 
 
260 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  68.55 
 
 
260 aa  345  5e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  67.19 
 
 
261 aa  345  6e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.4 
 
 
269 aa  342  4e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.06 
 
 
298 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.06 
 
 
298 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  72.07 
 
 
228 aa  338  7e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.67 
 
 
298 aa  338  8e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  66.23 
 
 
231 aa  325  6e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  65.35 
 
 
230 aa  321  8e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  66.53 
 
 
333 aa  319  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.39 
 
 
265 aa  311  6.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.83 
 
 
262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  56.22 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.63 
 
 
287 aa  291  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  60.17 
 
 
241 aa  271  6e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
233 aa  230  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  46.25 
 
 
564 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  48.93 
 
 
264 aa  225  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.48 
 
 
253 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.48 
 
 
253 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  45.76 
 
 
249 aa  222  4.9999999999999996e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.93 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.26 
 
 
249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  46.75 
 
 
239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.87 
 
 
267 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.19 
 
 
249 aa  218  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.34 
 
 
233 aa  218  6e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  45.41 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.77 
 
 
246 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.41 
 
 
252 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.35 
 
 
222 aa  216  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.8 
 
 
258 aa  215  7e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.1 
 
 
252 aa  215  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.32 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.26 
 
 
249 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.99 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.88 
 
 
267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.7 
 
 
255 aa  212  5.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.74 
 
 
267 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  43.67 
 
 
234 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  44.54 
 
 
240 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.42 
 
 
238 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.08 
 
 
260 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
249 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
249 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  45.65 
 
 
266 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.33 
 
 
255 aa  210  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.34 
 
 
251 aa  209  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.49 
 
 
252 aa  209  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.02 
 
 
249 aa  208  9e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.22 
 
 
252 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  41.53 
 
 
246 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  41.77 
 
 
248 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.31 
 
 
256 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  43.42 
 
 
231 aa  207  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  44.26 
 
 
266 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.13 
 
 
252 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  41.53 
 
 
263 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.1 
 
 
267 aa  205  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  44.98 
 
 
254 aa  205  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  41.74 
 
 
264 aa  205  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.11 
 
 
238 aa  204  9e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  42.86 
 
 
262 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3513  undecaprenyl diphosphate synthase  46.26 
 
 
230 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.161078  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  42.98 
 
 
246 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.64 
 
 
248 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.11 
 
 
266 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.78 
 
 
258 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  46.12 
 
 
247 aa  203  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.43 
 
 
247 aa  202  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  41.56 
 
 
257 aa  202  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  45.85 
 
 
257 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.67 
 
 
265 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.98 
 
 
252 aa  201  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.13 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>