More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0730 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
273 aa  559  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  80.23 
 
 
282 aa  421  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  75.4 
 
 
261 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  76.36 
 
 
270 aa  390  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  76.68 
 
 
260 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  75.98 
 
 
259 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  72.22 
 
 
271 aa  388  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  74.71 
 
 
264 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  71.32 
 
 
262 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  70.45 
 
 
271 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  70.08 
 
 
256 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  71.32 
 
 
269 aa  372  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  69.14 
 
 
262 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  68.92 
 
 
299 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  70.82 
 
 
261 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  67.69 
 
 
264 aa  365  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  74.6 
 
 
250 aa  363  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  67.06 
 
 
264 aa  358  7e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.93 
 
 
269 aa  357  9.999999999999999e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  67.33 
 
 
279 aa  355  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  69.77 
 
 
276 aa  355  5.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  65.34 
 
 
288 aa  354  8.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  66.27 
 
 
275 aa  353  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.86 
 
 
286 aa  353  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  67.95 
 
 
260 aa  347  8e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  70.5 
 
 
273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  64.29 
 
 
333 aa  330  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.78 
 
 
296 aa  329  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.6 
 
 
265 aa  325  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  69.47 
 
 
228 aa  324  9e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.4 
 
 
298 aa  322  4e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.4 
 
 
298 aa  322  4e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62 
 
 
298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.02 
 
 
287 aa  315  5e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  63.48 
 
 
231 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  57.43 
 
 
264 aa  304  9.000000000000001e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  63.04 
 
 
230 aa  304  9.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.22 
 
 
262 aa  295  8e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  61.04 
 
 
241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  47.43 
 
 
564 aa  240  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.33 
 
 
222 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.19 
 
 
233 aa  228  6e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.19 
 
 
244 aa  228  6e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.4 
 
 
247 aa  228  9e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  48.45 
 
 
259 aa  228  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.93 
 
 
255 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
252 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.93 
 
 
255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  44.54 
 
 
240 aa  222  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.34 
 
 
246 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.49 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  43.22 
 
 
249 aa  219  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.58 
 
 
252 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.54 
 
 
258 aa  219  5e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  45.11 
 
 
256 aa  218  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  45.15 
 
 
244 aa  218  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
252 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.6 
 
 
233 aa  217  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  42.8 
 
 
264 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  46.35 
 
 
266 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.04 
 
 
249 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.15 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
253 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
253 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  47.86 
 
 
266 aa  216  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  47.5 
 
 
262 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.41 
 
 
251 aa  215  7e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.39 
 
 
252 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.28 
 
 
267 aa  214  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  47.66 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3513  undecaprenyl diphosphate synthase  48.25 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.161078  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.66 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  48.47 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.38 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.19 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  44.35 
 
 
257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.19 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.87 
 
 
243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.61 
 
 
238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.4 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  42.68 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  43.16 
 
 
263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.02 
 
 
267 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.81 
 
 
251 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  42.55 
 
 
275 aa  211  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.61 
 
 
238 aa  211  7e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.42 
 
 
267 aa  211  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  42.79 
 
 
239 aa  211  9e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  44.83 
 
 
253 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.7 
 
 
256 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  44.49 
 
 
240 aa  211  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.7 
 
 
256 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.92 
 
 
249 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  42.55 
 
 
275 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  42.55 
 
 
275 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.9 
 
 
252 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  42.55 
 
 
275 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  45.26 
 
 
251 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>