More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1177 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
261 aa  528  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  81.18 
 
 
259 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  83.53 
 
 
264 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  80.78 
 
 
282 aa  408  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  76.17 
 
 
269 aa  394  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  75.4 
 
 
273 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  73.52 
 
 
276 aa  384  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  74.32 
 
 
270 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  70.59 
 
 
271 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  73.6 
 
 
261 aa  383  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  73.31 
 
 
256 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  73.46 
 
 
260 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  70.92 
 
 
271 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.38 
 
 
279 aa  378  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  70 
 
 
275 aa  374  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.2 
 
 
286 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  72.73 
 
 
262 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  69.29 
 
 
299 aa  363  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  74.19 
 
 
260 aa  363  2e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  73.6 
 
 
250 aa  362  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  67.47 
 
 
288 aa  361  6e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.77 
 
 
264 aa  361  8e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  71.32 
 
 
273 aa  358  6e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  68.42 
 
 
262 aa  352  2.9999999999999997e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.25 
 
 
264 aa  347  2e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  73.42 
 
 
228 aa  341  5.999999999999999e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.37 
 
 
269 aa  340  1e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.4 
 
 
296 aa  333  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.14 
 
 
265 aa  326  3e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  66.27 
 
 
333 aa  324  7e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.75 
 
 
298 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.75 
 
 
298 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.35 
 
 
298 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.3 
 
 
287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  57.43 
 
 
264 aa  311  5.999999999999999e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  64.5 
 
 
231 aa  308  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  63.48 
 
 
230 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.63 
 
 
262 aa  301  1e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  57.14 
 
 
241 aa  254  8e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.4 
 
 
252 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52 
 
 
252 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.31 
 
 
252 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.8 
 
 
252 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52 
 
 
244 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.82 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.26 
 
 
252 aa  241  7.999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.26 
 
 
251 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  48.79 
 
 
564 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.09 
 
 
233 aa  237  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  51.53 
 
 
266 aa  232  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.86 
 
 
238 aa  232  6e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.86 
 
 
238 aa  231  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  51.1 
 
 
254 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.95 
 
 
254 aa  229  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.95 
 
 
254 aa  228  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  46.72 
 
 
240 aa  228  9e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.73 
 
 
249 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  46.61 
 
 
249 aa  227  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  51.52 
 
 
264 aa  226  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.41 
 
 
248 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.53 
 
 
233 aa  226  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
255 aa  225  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  51.53 
 
 
257 aa  224  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  48.13 
 
 
256 aa  224  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
247 aa  224  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.74 
 
 
255 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.77 
 
 
256 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
247 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.46 
 
 
249 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.49 
 
 
259 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.66 
 
 
237 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.25 
 
 
255 aa  221  7e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  47.66 
 
 
244 aa  221  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.64 
 
 
247 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.28 
 
 
245 aa  221  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  44.08 
 
 
264 aa  219  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
255 aa  219  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.67 
 
 
222 aa  219  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  43.03 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  46.44 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  44.49 
 
 
275 aa  219  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  46.93 
 
 
276 aa  218  5e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  47.37 
 
 
282 aa  218  6e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  45.16 
 
 
263 aa  218  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.92 
 
 
257 aa  218  6e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  46.05 
 
 
291 aa  218  6e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
243 aa  218  8.999999999999998e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  44.08 
 
 
275 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  44.08 
 
 
275 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.98 
 
 
267 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  44.08 
 
 
275 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  46.93 
 
 
272 aa  218  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  45.41 
 
 
239 aa  217  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.15 
 
 
267 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  44.08 
 
 
275 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
254 aa  216  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  46.49 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
254 aa  216  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>