More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1385 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  69.36 
 
 
254 aa  337  9e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  68.94 
 
 
254 aa  336  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  69 
 
 
255 aa  327  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.38 
 
 
251 aa  320  9.000000000000001e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  62.98 
 
 
247 aa  318  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.53 
 
 
252 aa  318  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  62.55 
 
 
247 aa  315  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.83 
 
 
252 aa  311  3.9999999999999997e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  64.78 
 
 
266 aa  308  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.98 
 
 
252 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  61.9 
 
 
255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  63.2 
 
 
254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.13 
 
 
252 aa  304  7e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  63.52 
 
 
257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.28 
 
 
252 aa  301  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.47 
 
 
252 aa  301  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.26 
 
 
248 aa  301  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  64.38 
 
 
267 aa  297  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.09 
 
 
252 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3833  undecaprenyl diphosphate synthase  60.43 
 
 
260 aa  286  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0123862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  59.31 
 
 
259 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  59.31 
 
 
259 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  59.4 
 
 
259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.27 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.89 
 
 
245 aa  265  4e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  56.64 
 
 
254 aa  258  6e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.66 
 
 
253 aa  251  7e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.66 
 
 
253 aa  251  7e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  52.38 
 
 
256 aa  247  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  51.09 
 
 
252 aa  246  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  53.42 
 
 
236 aa  246  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  52.63 
 
 
259 aa  246  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.63 
 
 
248 aa  246  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  48.7 
 
 
240 aa  246  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
243 aa  244  9e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
244 aa  244  9e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  54.63 
 
 
228 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  48.7 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
264 aa  240  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.78 
 
 
241 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
249 aa  239  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  53.07 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.71 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  52.14 
 
 
236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
241 aa  238  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
261 aa  238  8e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.14 
 
 
249 aa  238  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  48.91 
 
 
251 aa  237  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.81 
 
 
243 aa  237  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1364  undecaprenyl diphosphate synthase  51.1 
 
 
247 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2707  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.1 
 
 
247 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  48.92 
 
 
257 aa  236  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.6 
 
 
249 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.58 
 
 
251 aa  234  8e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.9 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.23 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  48.71 
 
 
234 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  48.09 
 
 
252 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.92 
 
 
256 aa  229  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
258 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.58 
 
 
246 aa  229  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.62 
 
 
256 aa  229  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2151  undecaprenyl diphosphate synthase  51.1 
 
 
245 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.48 
 
 
252 aa  229  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  48.07 
 
 
251 aa  228  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.83 
 
 
251 aa  228  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.91 
 
 
260 aa  228  6e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  47.86 
 
 
262 aa  227  9e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  45.69 
 
 
276 aa  228  9e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.4 
 
 
258 aa  227  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.41 
 
 
247 aa  227  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
265 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.7 
 
 
257 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1373  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.22 
 
 
236 aa  226  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0884424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  48.71 
 
 
263 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.14 
 
 
257 aa  226  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  43.35 
 
 
282 aa  226  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3995  undecaprenyl diphosphate synthase  51.09 
 
 
244 aa  226  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.699417  normal  0.221375 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 
247 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  43.53 
 
 
276 aa  225  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.97 
 
 
257 aa  225  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.02 
 
 
238 aa  225  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2174  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  46.12 
 
 
272 aa  225  5.0000000000000005e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  48.47 
 
 
238 aa  224  6e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.45 
 
 
238 aa  225  6e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  45.69 
 
 
246 aa  224  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  49.14 
 
 
260 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  49.14 
 
 
260 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
246 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.48 
 
 
267 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  48.93 
 
 
260 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  49.14 
 
 
260 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  43.83 
 
 
251 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1493  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
250 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.47 
 
 
233 aa  224  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.92 
 
 
267 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1945  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
231 aa  223  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.77987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>