More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2119 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
333 aa  664    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  83.4 
 
 
265 aa  428  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  66.27 
 
 
261 aa  351  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  68.77 
 
 
271 aa  350  3e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  66.4 
 
 
299 aa  348  5e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  71.37 
 
 
269 aa  348  5e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  65.32 
 
 
275 aa  347  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.73 
 
 
286 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  68.25 
 
 
259 aa  346  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.94 
 
 
279 aa  344  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  73.49 
 
 
250 aa  342  5e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  70.73 
 
 
256 aa  342  7e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  66.53 
 
 
271 aa  341  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  64.29 
 
 
273 aa  338  8e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  68.25 
 
 
276 aa  338  9e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  67.74 
 
 
261 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.18 
 
 
282 aa  335  7e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  63.6 
 
 
288 aa  335  9e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  67.32 
 
 
264 aa  329  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  64.03 
 
 
262 aa  329  3e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.56 
 
 
264 aa  329  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  64.71 
 
 
262 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.06 
 
 
264 aa  326  3e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  70.56 
 
 
260 aa  325  6e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.55 
 
 
269 aa  322  5e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  70.8 
 
 
273 aa  322  8e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  65.62 
 
 
270 aa  316  4e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  67.2 
 
 
260 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.98 
 
 
296 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.78 
 
 
262 aa  305  6e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  57.14 
 
 
264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  68.61 
 
 
228 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.03 
 
 
298 aa  292  7e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.03 
 
 
298 aa  292  7e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.03 
 
 
298 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  58.77 
 
 
230 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.57 
 
 
287 aa  280  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  58.77 
 
 
231 aa  280  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  59.05 
 
 
241 aa  258  7e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
233 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  53.04 
 
 
266 aa  242  6e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.79 
 
 
244 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
252 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.13 
 
 
233 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
252 aa  233  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 
255 aa  232  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.64 
 
 
252 aa  231  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  46.04 
 
 
564 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
252 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  52.14 
 
 
264 aa  230  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  51.74 
 
 
257 aa  228  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
252 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
252 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.26 
 
 
248 aa  227  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.44 
 
 
249 aa  226  4e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.34 
 
 
252 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  47.66 
 
 
247 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  47.23 
 
 
247 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.86 
 
 
251 aa  222  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  48.26 
 
 
266 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1364  undecaprenyl diphosphate synthase  49.8 
 
 
247 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2707  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.8 
 
 
247 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.22 
 
 
237 aa  222  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  44.58 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.33 
 
 
222 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  48 
 
 
259 aa  221  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.91 
 
 
245 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  45.38 
 
 
249 aa  220  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.06 
 
 
255 aa  218  8.999999999999998e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.9 
 
 
256 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.64 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  48.03 
 
 
254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  43.48 
 
 
239 aa  216  5e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
258 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  44.16 
 
 
234 aa  216  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
259 aa  215  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.91 
 
 
254 aa  215  9e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.52 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.52 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2151  undecaprenyl diphosphate synthase  50.42 
 
 
245 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 
268 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.19 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.47 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.16 
 
 
241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.81 
 
 
243 aa  213  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  50.87 
 
 
267 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  44.98 
 
 
254 aa  212  9e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
259 aa  212  9e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
259 aa  212  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.03 
 
 
255 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.48 
 
 
238 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  48.47 
 
 
254 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  48.9 
 
 
254 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1712  undecaprenyl diphosphate synthase  42.92 
 
 
252 aa  210  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  44.3 
 
 
282 aa  209  4e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.87 
 
 
260 aa  209  4e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.68 
 
 
248 aa  209  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.54 
 
 
249 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  43.86 
 
 
291 aa  209  7e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>