More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0633 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
267 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  83.15 
 
 
257 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  74.14 
 
 
259 aa  344  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  74.14 
 
 
259 aa  344  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  75.11 
 
 
259 aa  342  4e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  70.09 
 
 
251 aa  329  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  67.8 
 
 
252 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  67.63 
 
 
252 aa  328  6e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  67.63 
 
 
252 aa  324  7e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  68.64 
 
 
266 aa  323  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  67.23 
 
 
252 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.38 
 
 
252 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  65.11 
 
 
255 aa  317  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  64.96 
 
 
247 aa  314  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  65.95 
 
 
252 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.38 
 
 
237 aa  311  7.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  64.1 
 
 
247 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.93 
 
 
252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.97 
 
 
248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.81 
 
 
254 aa  301  5.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.81 
 
 
254 aa  301  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.53 
 
 
255 aa  301  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  64.63 
 
 
254 aa  300  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3833  undecaprenyl diphosphate synthase  63.25 
 
 
260 aa  298  9e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0123862 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.47 
 
 
244 aa  278  8e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.63 
 
 
243 aa  262  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.79 
 
 
245 aa  257  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  54.22 
 
 
254 aa  255  5e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.33 
 
 
248 aa  254  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  54.55 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.17 
 
 
259 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  54.11 
 
 
252 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.72 
 
 
233 aa  249  3e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 
248 aa  249  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  52.81 
 
 
266 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  56.44 
 
 
254 aa  248  5e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
276 aa  248  6e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  47.49 
 
 
263 aa  248  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
240 aa  248  6e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.2 
 
 
256 aa  247  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.76 
 
 
256 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.76 
 
 
256 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
276 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.91 
 
 
249 aa  246  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.92 
 
 
253 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.92 
 
 
253 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.36 
 
 
233 aa  246  4e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  53.51 
 
 
244 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  54.7 
 
 
260 aa  245  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  51.72 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.49 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  54.7 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  52.94 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  54.7 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  50 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  53.42 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  54.7 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.65 
 
 
251 aa  243  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
234 aa  243  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
251 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  54.27 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  54.27 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  54.27 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  54.27 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  54.7 
 
 
260 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  54.7 
 
 
260 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  50.64 
 
 
245 aa  241  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  47.44 
 
 
282 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  48.25 
 
 
259 aa  241  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.5 
 
 
253 aa  240  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.58 
 
 
249 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.03 
 
 
247 aa  240  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1346  undecaprenyl diphosphate synthase  52.99 
 
 
258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0661425  normal  0.552617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.85 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  52.36 
 
 
261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  53.85 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  53.85 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  53.85 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.52 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 
249 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.72 
 
 
249 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  52.99 
 
 
260 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.27 
 
 
267 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1282  undecaprenyl diphosphate synthase  52.14 
 
 
258 aa  238  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.222938 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  53.07 
 
 
273 aa  238  8e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1373  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.59 
 
 
236 aa  238  8e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0884424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.07 
 
 
257 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.34 
 
 
260 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  47.44 
 
 
240 aa  238  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.13 
 
 
248 aa  236  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  51.91 
 
 
260 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.13 
 
 
249 aa  236  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.3 
 
 
260 aa  236  3e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  51.71 
 
 
248 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
265 aa  235  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  51.71 
 
 
236 aa  235  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  50.85 
 
 
262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.64 
 
 
249 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2151  undecaprenyl diphosphate synthase  54.63 
 
 
245 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
243 aa  235  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>