More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2440 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 		 252 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  88.49 
 
 		 252 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  88.49 
 
 		 252 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  86.9 
 
 		 252 aa  447  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  86.9 
 
 		 252 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  87.4 
 
 		 251 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  87.3 
 
 		 252 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  68.51 
 
 		 255 aa  330  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  64.71 
 
 		 266 aa  325  6e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  68.09 
 
 		 257 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  62.35 
 
 		 254 aa  315  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  67.8 
 
 		 267 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.1 
 
 		 255 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.98 
 
 		 237 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.19 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.19 
 
 		 254 aa  302  4.0000000000000003e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3833  undecaprenyl diphosphate synthase  61.45 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0123862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  60.59 
 
 		 247 aa  298  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.43 
 
 		 248 aa  298  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  59.66 
 
 		 252 aa  297  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  63.79 
 
 		 259 aa  297  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  63.79 
 
 		 259 aa  297  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  59.75 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.68 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  64.96 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.71 
 
 		 245 aa  271  7e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  58.22 
 
 		 254 aa  260  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.3 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  48.1 
 
 		 248 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  52.3 
 
 		 248 aa  249  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.41 
 
 		 247 aa  248  6e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  50.63 
 
 		 243 aa  248  9e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  52.3 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  53.51 
 
 		 254 aa  247  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  52.8 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  51.5 
 
 		 234 aa  246  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  47.03 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.26 
 
 		 243 aa  239  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.51 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 		 236 aa  238  6.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.43 
 
 		 259 aa  238  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  47.66 
 
 		 253 aa  238  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.08 
 
 		 233 aa  238  8e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  48.93 
 
 		 259 aa  238  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  49.38 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.44 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.05 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.08 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.53 
 
 		 279 aa  236  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 		 266 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  45.96 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.44 
 
 		 238 aa  235  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  48.36 
 
 		 247 aa  235  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  44.62 
 
 		 276 aa  235  4e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.19 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.19 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  47.86 
 
 		 252 aa  234  7e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.28 
 
 		 260 aa  234  9e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.09 
 
 		 249 aa  234  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.59 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  45.61 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  47.41 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.57 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.09 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  47.23 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 		 260 aa  232  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 		 260 aa  232  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  48.12 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  47.81 
 
 		 276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  48.07 
 
 		 244 aa  232  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  47.68 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.79 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.6 
 
 		 266 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0052  undecaprenyl diphosphate synthase  46.15 
 
 		 231 aa  231  6e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000100505  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.18 
 
 		 267 aa  231  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  48.52 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  48.52 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.58 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  48.52 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  48.52 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0617  undecaprenyl diphosphate synthase  45.34 
 
 		 245 aa  230  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.79 
 
 		 286 aa  230  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.6 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.58 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2707  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.76 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1364  undecaprenyl diphosphate synthase  48.76 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  48.48 
 
 		 240 aa  229  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.71 
 
 		 245 aa  229  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.68 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  44.87 
 
 		 244 aa  229  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.26 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.26 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>