More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0566 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  100 
 
 		 238 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  95.8 
 
 		 238 aa  477  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  50.21 
 
 		 252 aa  268  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  52.61 
 
 		 262 aa  267  8e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.95 
 
 		 257 aa  264  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.11 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.02 
 
 		 251 aa  262  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.02 
 
 		 251 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.43 
 
 		 255 aa  258  7e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 		 261 aa  258  8e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 		 255 aa  258  8e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  51.29 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  51.32 
 
 		 264 aa  256  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.65 
 
 		 256 aa  255  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 		 254 aa  253  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.14 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  51.29 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 		 251 aa  252  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  50.44 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 		 251 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.05 
 
 		 248 aa  253  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 		 251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 		 251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.28 
 
 		 249 aa  251  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.15 
 
 		 267 aa  251  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  51.1 
 
 		 253 aa  251  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  50.43 
 
 		 251 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  50.43 
 
 		 266 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.78 
 
 		 261 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.28 
 
 		 251 aa  251  9.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  47.03 
 
 		 257 aa  251  9.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  50.88 
 
 		 271 aa  250  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  47.64 
 
 		 266 aa  250  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1346  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 		 258 aa  250  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0661425  normal  0.552617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1762  undecaprenyl diphosphate synthase  49.14 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.430712  normal  0.0678846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1282  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 		 258 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.222938 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 		 260 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2691  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.65 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.86 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.56 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.35 
 
 		 267 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.43 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.28 
 
 		 267 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 		 241 aa  248  4e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.86 
 
 		 260 aa  248  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 		 253 aa  248  5e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  50.65 
 
 		 288 aa  248  7e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 		 260 aa  248  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  50.22 
 
 		 264 aa  248  9e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  48.91 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  46.96 
 
 		 249 aa  247  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  48.5 
 
 		 264 aa  246  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38950  undecaprenyl diphosphate synthase  52.16 
 
 		 251 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.522438  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  47.64 
 
 		 265 aa  246  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  50.88 
 
 		 256 aa  245  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.57 
 
 		 253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.57 
 
 		 260 aa  244  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 		 256 aa  244  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 		 260 aa  244  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 		 260 aa  244  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  49.14 
 
 		 260 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  49.14 
 
 		 260 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 		 260 aa  244  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  49.14 
 
 		 260 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.52 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.19 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.14 
 
 		 275 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.14 
 
 		 275 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.92 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2972  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.906819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.14 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  48.28 
 
 		 266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.14 
 
 		 267 aa  242  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.84 
 
 		 249 aa  241  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.15 
 
 		 253 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  49.15 
 
 		 253 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.15 
 
 		 253 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.15 
 
 		 253 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.15 
 
 		 253 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 		 252 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.15 
 
 		 252 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1408  undecaprenyl pyrophosphate synthetase protein  47.83 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  48.71 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1526  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.43 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00254317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.15 
 
 		 252 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.73 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>