More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0464 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 
248 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  54.73 
 
 
254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  56.52 
 
 
247 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  56.52 
 
 
247 aa  268  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  58.33 
 
 
257 aa  268  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.46 
 
 
251 aa  261  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  57.64 
 
 
228 aa  261  8e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.51 
 
 
252 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.08 
 
 
244 aa  256  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.63 
 
 
237 aa  256  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.42 
 
 
252 aa  255  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.01 
 
 
252 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.02 
 
 
254 aa  254  7e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.02 
 
 
254 aa  254  7e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.99 
 
 
252 aa  254  9e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.58 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.43 
 
 
252 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.27 
 
 
248 aa  252  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1373  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.44 
 
 
236 aa  250  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0884424  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  50.88 
 
 
240 aa  249  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.61 
 
 
252 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  55.69 
 
 
267 aa  249  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.21 
 
 
247 aa  247  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  56.33 
 
 
254 aa  246  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.01 
 
 
267 aa  246  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.68 
 
 
241 aa  246  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.21 
 
 
252 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  52.16 
 
 
266 aa  244  9e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  47.6 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.15 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  55.26 
 
 
254 aa  243  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.15 
 
 
251 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  52.72 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.1 
 
 
258 aa  242  5e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
248 aa  241  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  54.19 
 
 
259 aa  241  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  54.19 
 
 
259 aa  241  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.42 
 
 
253 aa  239  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.86 
 
 
249 aa  240  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  52.86 
 
 
243 aa  238  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.37 
 
 
253 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.37 
 
 
253 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  49.18 
 
 
256 aa  238  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  51.24 
 
 
252 aa  237  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  48.33 
 
 
276 aa  237  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  55.9 
 
 
259 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  52.42 
 
 
253 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  49.38 
 
 
254 aa  236  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  51.5 
 
 
251 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.5 
 
 
249 aa  235  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  51.5 
 
 
251 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  51.07 
 
 
251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  51.5 
 
 
251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.17 
 
 
248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  47.66 
 
 
257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  47.84 
 
 
246 aa  234  7e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.55 
 
 
246 aa  234  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  49.58 
 
 
236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  48.46 
 
 
240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  47.18 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.28 
 
 
250 aa  232  3e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.22 
 
 
257 aa  233  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  50.87 
 
 
253 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  51.09 
 
 
251 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.28 
 
 
249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.95 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  49.18 
 
 
260 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  49.18 
 
 
260 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.34 
 
 
275 aa  231  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.34 
 
 
275 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.34 
 
 
275 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
247 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
251 aa  231  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1276  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
243 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0784677  normal  0.545818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  48.77 
 
 
260 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1364  undecaprenyl diphosphate synthase  52.32 
 
 
247 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
261 aa  230  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2707  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.32 
 
 
247 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.18 
 
 
260 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  50.64 
 
 
248 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0486  undecaprenyl diphosphate synthase  51.98 
 
 
294 aa  230  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.407745 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2151  undecaprenyl diphosphate synthase  53.54 
 
 
245 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  48.77 
 
 
260 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  48.77 
 
 
260 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  47.21 
 
 
251 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  49.59 
 
 
260 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  49.59 
 
 
260 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  49.59 
 
 
260 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  49.59 
 
 
260 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  49.59 
 
 
260 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  47.95 
 
 
260 aa  229  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  49.59 
 
 
260 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  51.54 
 
 
262 aa  229  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  48.03 
 
 
263 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.34 
 
 
256 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.96 
 
 
256 aa  229  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
249 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  47.54 
 
 
260 aa  228  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>