More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3785 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  83 
 
 
253 aa  431  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  83 
 
 
253 aa  431  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1071  undecaprenyl pyrophosphate synthase  83.73 
 
 
252 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00176842  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3430  undecaprenyl pyrophosphate synthase  83.73 
 
 
252 aa  429  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00762584  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1018  undecaprenyl pyrophosphate synthase  83.73 
 
 
252 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000425553  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  79.84 
 
 
253 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  83 
 
 
252 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0743722  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  81.3 
 
 
252 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.296524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  81.3 
 
 
252 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00664761  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  81.3 
 
 
252 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0246  undecaprenyl pyrophosphate synthase  81.3 
 
 
252 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0259  undecaprenyl pyrophosphate synthase  81.3 
 
 
252 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.324297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  78.86 
 
 
253 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  78.86 
 
 
252 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  78.86 
 
 
253 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  78.86 
 
 
253 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  77.87 
 
 
253 aa  407  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  78.86 
 
 
253 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  78.86 
 
 
252 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  78.86 
 
 
253 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  78.86 
 
 
252 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  78.46 
 
 
252 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0532  undecaprenyl diphosphate synthase  71.07 
 
 
253 aa  370  1e-101  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  63.33 
 
 
246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.45 
 
 
241 aa  313  9.999999999999999e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  63.32 
 
 
254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  61.8 
 
 
261 aa  307  9e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.32 
 
 
275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.32 
 
 
275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1274  undecaprenyl diphosphate synthase  62.88 
 
 
274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.278229  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.32 
 
 
275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  62.88 
 
 
275 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  62.45 
 
 
275 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  62.45 
 
 
275 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  62.45 
 
 
275 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  62.45 
 
 
271 aa  305  6e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  62.45 
 
 
275 aa  304  7e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  62.01 
 
 
264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  62.45 
 
 
266 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.14 
 
 
257 aa  300  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2972  undecaprenyl diphosphate synthase  60.96 
 
 
259 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.906819 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  62.01 
 
 
275 aa  300  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  59.83 
 
 
256 aa  298  7e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  62.01 
 
 
263 aa  297  9e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  61.57 
 
 
266 aa  297  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  60.43 
 
 
264 aa  293  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.95 
 
 
251 aa  290  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  58.52 
 
 
251 aa  287  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0567  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.52 
 
 
252 aa  276  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  54.92 
 
 
262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.73 
 
 
257 aa  268  5.9999999999999995e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  55.9 
 
 
256 aa  267  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  54.35 
 
 
240 aa  267  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  56.09 
 
 
251 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  56.09 
 
 
251 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  52.17 
 
 
252 aa  263  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  55.65 
 
 
251 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.22 
 
 
251 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  55.65 
 
 
251 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  55.22 
 
 
251 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  55.17 
 
 
244 aa  260  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.65 
 
 
260 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  54.35 
 
 
257 aa  259  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.22 
 
 
251 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  54.78 
 
 
251 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.22 
 
 
251 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  56.28 
 
 
260 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.84 
 
 
255 aa  259  3e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.42 
 
 
261 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.65 
 
 
248 aa  257  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1541  undecaprenyl diphosphate synthase  53.71 
 
 
237 aa  257  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0612  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.71 
 
 
237 aa  257  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204719  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  53.91 
 
 
260 aa  255  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  55.36 
 
 
261 aa  255  6e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.85 
 
 
256 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.97 
 
 
255 aa  254  9e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.9 
 
 
255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1276  undecaprenyl diphosphate synthase  53.88 
 
 
243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0784677  normal  0.545818 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  53.48 
 
 
257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  54.11 
 
 
260 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  54.55 
 
 
260 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  54.11 
 
 
260 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  54.11 
 
 
260 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38950  undecaprenyl diphosphate synthase  54.35 
 
 
251 aa  251  8.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.522438  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.11 
 
 
260 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  53.68 
 
 
260 aa  250  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1282  undecaprenyl diphosphate synthase  54.78 
 
 
258 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.222938 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  54.11 
 
 
260 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  54.11 
 
 
260 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  53.68 
 
 
260 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  53.68 
 
 
260 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  54.11 
 
 
260 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1346  undecaprenyl diphosphate synthase  53.91 
 
 
258 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0661425  normal  0.552617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  52.61 
 
 
265 aa  248  5e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  53.68 
 
 
260 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  53.68 
 
 
260 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  53.68 
 
 
260 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  53.68 
 
 
260 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.66 
 
 
238 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>