More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1356 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
240 aa  492  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  62.34 
 
 
246 aa  319  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.39 
 
 
258 aa  300  9e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.08 
 
 
246 aa  285  7e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  56.49 
 
 
246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.07 
 
 
253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.07 
 
 
253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  55.23 
 
 
245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  55.98 
 
 
253 aa  279  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  56.71 
 
 
266 aa  278  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.08 
 
 
246 aa  276  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  55.46 
 
 
253 aa  275  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  54.81 
 
 
253 aa  275  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.27 
 
 
249 aa  270  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.17 
 
 
249 aa  268  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  55.51 
 
 
263 aa  268  8e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  54.35 
 
 
252 aa  267  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  54.17 
 
 
260 aa  267  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  53.91 
 
 
253 aa  267  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  53.91 
 
 
253 aa  267  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.82 
 
 
252 aa  266  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.62 
 
 
256 aa  266  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.82 
 
 
253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  54.82 
 
 
252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.82 
 
 
253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  54.82 
 
 
253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.82 
 
 
253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.82 
 
 
252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.82 
 
 
253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.82 
 
 
252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.24 
 
 
249 aa  265  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  53.65 
 
 
272 aa  264  8e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  53.16 
 
 
261 aa  264  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  53.88 
 
 
254 aa  263  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  52.79 
 
 
285 aa  263  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  52.79 
 
 
276 aa  261  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  52.36 
 
 
276 aa  261  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.95 
 
 
252 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00664761  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.95 
 
 
252 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0259  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.95 
 
 
252 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.324297 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0246  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.95 
 
 
252 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4387  undecaprenyl diphosphate synthase  50.83 
 
 
250 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.58 
 
 
256 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.95 
 
 
252 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.296524 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.07 
 
 
247 aa  259  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.39 
 
 
246 aa  259  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.99 
 
 
251 aa  258  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  52.79 
 
 
256 aa  257  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1018  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.17 
 
 
252 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000425553  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  52.36 
 
 
291 aa  256  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1071  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.17 
 
 
252 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00176842  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3430  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.17 
 
 
252 aa  257  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00762584  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.51 
 
 
252 aa  256  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0743722  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  52.14 
 
 
246 aa  256  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  52.36 
 
 
282 aa  256  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  53.51 
 
 
273 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.36 
 
 
249 aa  255  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.79 
 
 
257 aa  255  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
263 aa  255  6e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  51.97 
 
 
247 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  48.51 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.56 
 
 
260 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.19 
 
 
258 aa  252  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  52.14 
 
 
260 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  52.14 
 
 
260 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.49 
 
 
241 aa  252  3e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  52.14 
 
 
260 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  52.38 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.3 
 
 
253 aa  251  5.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
264 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 
251 aa  252  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  51.07 
 
 
256 aa  251  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.79 
 
 
257 aa  251  7e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  50.85 
 
 
262 aa  250  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.52 
 
 
261 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  48.9 
 
 
252 aa  250  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
249 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  51.71 
 
 
260 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
260 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  49.57 
 
 
257 aa  250  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
260 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
249 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
275 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0532  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
253 aa  249  3e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  49.58 
 
 
265 aa  248  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.93 
 
 
282 aa  248  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  51.07 
 
 
251 aa  248  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.64 
 
 
251 aa  248  9e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
275 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
275 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
249 aa  247  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  50.44 
 
 
249 aa  247  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
238 aa  247  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
260 aa  247  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
275 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  51.32 
 
 
251 aa  246  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2174  undecaprenyl diphosphate synthase  48.74 
 
 
255 aa  246  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.17 
 
 
257 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
260 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>