More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0985 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
246 aa  512  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  63.97 
 
 
260 aa  340  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  61.32 
 
 
245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  60 
 
 
253 aa  317  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  58.37 
 
 
246 aa  307  9e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4387  undecaprenyl diphosphate synthase  56.56 
 
 
250 aa  300  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  57.45 
 
 
276 aa  296  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  57.83 
 
 
273 aa  294  9e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  55.93 
 
 
285 aa  293  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  54.04 
 
 
276 aa  288  6e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.26 
 
 
282 aa  285  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  54.7 
 
 
291 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  56.49 
 
 
240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.47 
 
 
258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  53.62 
 
 
282 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  56.6 
 
 
272 aa  282  4.0000000000000003e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  53.14 
 
 
288 aa  279  3e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  54.17 
 
 
257 aa  278  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  52.92 
 
 
263 aa  274  8e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.74 
 
 
249 aa  272  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.56 
 
 
249 aa  269  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.94 
 
 
249 aa  268  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.13 
 
 
256 aa  266  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.48 
 
 
259 aa  265  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  50.83 
 
 
261 aa  263  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.25 
 
 
253 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.25 
 
 
253 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.54 
 
 
241 aa  263  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0190  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.27 
 
 
254 aa  262  4e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.763759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.97 
 
 
246 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  51.9 
 
 
266 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.27 
 
 
246 aa  258  8e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  52.14 
 
 
251 aa  256  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.87 
 
 
251 aa  256  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  52.08 
 
 
248 aa  255  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  51.06 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  47.92 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.81 
 
 
249 aa  251  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
251 aa  251  8.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.55 
 
 
257 aa  251  8.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
251 aa  251  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  51.52 
 
 
244 aa  251  9.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.75 
 
 
246 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.66 
 
 
249 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  47.92 
 
 
254 aa  249  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.1 
 
 
249 aa  248  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45.34 
 
 
252 aa  248  5e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  49.13 
 
 
249 aa  248  5e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.16 
 
 
252 aa  248  8e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.66 
 
 
249 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
260 aa  247  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
260 aa  247  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
252 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00664761  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0246  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
252 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.704245 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  48.76 
 
 
256 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
252 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0259  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
252 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.324297 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  49.16 
 
 
260 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  49.16 
 
 
260 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.66 
 
 
257 aa  246  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.23 
 
 
249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.81 
 
 
246 aa  244  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  49.16 
 
 
260 aa  244  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  49.16 
 
 
260 aa  244  8e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.84 
 
 
251 aa  244  8e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
271 aa  244  8e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  49.16 
 
 
260 aa  244  8e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  49.16 
 
 
260 aa  244  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0243  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
252 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.296524 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  49.37 
 
 
260 aa  244  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.95 
 
 
260 aa  244  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.23 
 
 
248 aa  244  9e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.74 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  47.01 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  47.74 
 
 
265 aa  243  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
260 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
260 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  46.41 
 
 
262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.36 
 
 
238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.88 
 
 
267 aa  242  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  47.81 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  47.9 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  46.06 
 
 
264 aa  241  5e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  46.81 
 
 
259 aa  242  5e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.95 
 
 
259 aa  242  5e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  47.86 
 
 
231 aa  241  6e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.38 
 
 
256 aa  241  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
253 aa  241  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
252 aa  241  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
252 aa  241  7.999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0743722  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
253 aa  241  9e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  48.73 
 
 
246 aa  241  9e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.81 
 
 
275 aa  241  9e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.81 
 
 
275 aa  241  9e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.36 
 
 
238 aa  240  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  48.54 
 
 
260 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.81 
 
 
275 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  48.54 
 
 
260 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  48.54 
 
 
260 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  47.44 
 
 
266 aa  240  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>