More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0401 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  71.43 
 
 
276 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  70.48 
 
 
276 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.29 
 
 
282 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  64.79 
 
 
282 aa  382  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  63.1 
 
 
291 aa  373  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  65.79 
 
 
285 aa  373  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  56.2 
 
 
273 aa  298  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  55.65 
 
 
253 aa  298  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  55.13 
 
 
245 aa  285  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  56.6 
 
 
246 aa  282  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  50.79 
 
 
288 aa  281  6.000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  53.53 
 
 
260 aa  276  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.98 
 
 
249 aa  275  8e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.98 
 
 
249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.81 
 
 
246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4387  undecaprenyl diphosphate synthase  52.07 
 
 
250 aa  272  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.62 
 
 
257 aa  271  6e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  54.47 
 
 
251 aa  271  7e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.81 
 
 
256 aa  270  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.04 
 
 
251 aa  268  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.97 
 
 
246 aa  267  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  52.77 
 
 
256 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0190  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.75 
 
 
254 aa  265  5e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.763759 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  53.65 
 
 
240 aa  264  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  48.82 
 
 
254 aa  264  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  48.12 
 
 
271 aa  263  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.42 
 
 
257 aa  263  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.99 
 
 
258 aa  262  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
246 aa  261  6.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50 
 
 
256 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.57 
 
 
261 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  52.84 
 
 
263 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  51.91 
 
 
260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  51.91 
 
 
260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.39 
 
 
259 aa  258  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
256 aa  257  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  51.91 
 
 
260 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  51.91 
 
 
260 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  51.91 
 
 
260 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  51.91 
 
 
260 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  51.49 
 
 
260 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  51.91 
 
 
260 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  51.06 
 
 
260 aa  255  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  49 
 
 
266 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  50.84 
 
 
251 aa  255  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  47.28 
 
 
275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  48.93 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
260 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
251 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
251 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.36 
 
 
248 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.21 
 
 
260 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  46.86 
 
 
275 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  46.86 
 
 
275 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  46.86 
 
 
275 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
260 aa  252  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  46.86 
 
 
275 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  46.72 
 
 
262 aa  251  7e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  45.64 
 
 
264 aa  251  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.16 
 
 
253 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.16 
 
 
253 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.51 
 
 
251 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.06 
 
 
251 aa  251  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
260 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  47.77 
 
 
249 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  50.42 
 
 
253 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
246 aa  250  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.15 
 
 
275 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.15 
 
 
275 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
260 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.15 
 
 
275 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  46.86 
 
 
266 aa  251  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
260 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.54 
 
 
254 aa  250  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
261 aa  250  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  48.51 
 
 
251 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
260 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.34 
 
 
249 aa  249  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.54 
 
 
254 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
260 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.94 
 
 
260 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1346  undecaprenyl diphosphate synthase  49.58 
 
 
258 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0661425  normal  0.552617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.93 
 
 
243 aa  248  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  46.81 
 
 
251 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  47.23 
 
 
251 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.27 
 
 
246 aa  248  9e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1282  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
258 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.222938 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  44.35 
 
 
264 aa  247  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  46.44 
 
 
275 aa  246  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.51 
 
 
251 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.51 
 
 
251 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  44.77 
 
 
263 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  48.26 
 
 
247 aa  246  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
261 aa  245  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1462  undecaprenyl diphosphate synthase  51.26 
 
 
259 aa  246  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.101817  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  49.58 
 
 
265 aa  245  6e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.25 
 
 
249 aa  245  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.75 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>