More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0464 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  100 
 
 
285 aa  597  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  69.82 
 
 
282 aa  420  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  64.6 
 
 
276 aa  395  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  63.74 
 
 
291 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  62.63 
 
 
282 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  65.79 
 
 
272 aa  373  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  62.69 
 
 
276 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  59.09 
 
 
273 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  55.93 
 
 
246 aa  293  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  56.78 
 
 
253 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  55.74 
 
 
245 aa  288  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  52.52 
 
 
260 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.1 
 
 
257 aa  275  6e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.1 
 
 
246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.59 
 
 
253 aa  271  7e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.59 
 
 
253 aa  271  7e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.59 
 
 
257 aa  270  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  50.43 
 
 
288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4387  undecaprenyl diphosphate synthase  50.83 
 
 
250 aa  268  7e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.6 
 
 
256 aa  267  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
246 aa  267  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.17 
 
 
251 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  47.88 
 
 
254 aa  265  5e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.1 
 
 
246 aa  265  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  49.58 
 
 
251 aa  265  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  50.42 
 
 
256 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.04 
 
 
249 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.62 
 
 
249 aa  265  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
261 aa  263  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  52.79 
 
 
240 aa  263  3e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  51.27 
 
 
251 aa  262  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  50.85 
 
 
246 aa  261  8e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  49.59 
 
 
266 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  46.49 
 
 
263 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.2 
 
 
259 aa  258  7e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  48.31 
 
 
251 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  49.15 
 
 
257 aa  255  6e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  47.88 
 
 
251 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  47.88 
 
 
251 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
247 aa  255  7e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.33 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  45.93 
 
 
251 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
251 aa  251  7e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.86 
 
 
256 aa  251  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  45.34 
 
 
263 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
249 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
249 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.1 
 
 
246 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.87 
 
 
249 aa  250  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.97 
 
 
243 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.14 
 
 
258 aa  249  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.14 
 
 
258 aa  249  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  51.03 
 
 
256 aa  249  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.78 
 
 
251 aa  248  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
258 aa  248  9e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
258 aa  248  9e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  48.15 
 
 
265 aa  248  9e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
258 aa  248  9e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
258 aa  248  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  48.32 
 
 
248 aa  248  9e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0190  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
254 aa  248  1e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.763759 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
258 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
258 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.64 
 
 
261 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
258 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.71 
 
 
257 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  46.67 
 
 
262 aa  246  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45 
 
 
252 aa  246  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  48.26 
 
 
253 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.29 
 
 
258 aa  247  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.03 
 
 
251 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.14 
 
 
258 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.03 
 
 
251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  49.58 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  45.83 
 
 
256 aa  245  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3430  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.15 
 
 
252 aa  245  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00762584  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  49.58 
 
 
253 aa  245  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1018  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.15 
 
 
252 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000425553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1071  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.15 
 
 
252 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00176842  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.39 
 
 
241 aa  245  6.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  43.64 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  46.06 
 
 
241 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  45.76 
 
 
251 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  46.19 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.73 
 
 
275 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1346  undecaprenyl diphosphate synthase  45.16 
 
 
258 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0661425  normal  0.552617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
249 aa  241  7e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  44.26 
 
 
271 aa  242  7e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  47.68 
 
 
260 aa  241  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  48.51 
 
 
260 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.36 
 
 
251 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  48.09 
 
 
260 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  48.09 
 
 
260 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.56 
 
 
244 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.77 
 
 
254 aa  241  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  47.22 
 
 
264 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38950  undecaprenyl diphosphate synthase  49.58 
 
 
251 aa  240  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.522438  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.78 
 
 
249 aa  241  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.77 
 
 
254 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>