More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1750 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  100 
 
 
291 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  74.35 
 
 
276 aa  435  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  72.53 
 
 
282 aa  432  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  70.7 
 
 
282 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  65.68 
 
 
276 aa  388  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  63.74 
 
 
285 aa  380  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  63.1 
 
 
272 aa  373  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  55.86 
 
 
273 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  54.7 
 
 
246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  54.47 
 
 
253 aa  281  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4387  undecaprenyl diphosphate synthase  51.42 
 
 
250 aa  270  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.91 
 
 
257 aa  268  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  53.42 
 
 
245 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  51.44 
 
 
260 aa  265  5e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.71 
 
 
249 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
251 aa  258  8e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  47.46 
 
 
254 aa  257  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  52.36 
 
 
240 aa  256  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  45.77 
 
 
288 aa  256  3e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  49.6 
 
 
266 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.71 
 
 
249 aa  255  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  51.26 
 
 
261 aa  255  7e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.94 
 
 
251 aa  254  8e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.2 
 
 
257 aa  254  9e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.85 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  49.36 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  49.4 
 
 
263 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  47.66 
 
 
256 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2544  undecaprenyl diphosphate synthase  49.58 
 
 
256 aa  251  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0190  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.62 
 
 
254 aa  251  1e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.763759 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.01 
 
 
258 aa  249  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  52.17 
 
 
247 aa  249  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  44.77 
 
 
264 aa  248  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.75 
 
 
259 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  46.91 
 
 
246 aa  246  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.94 
 
 
246 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
262 aa  246  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  44.44 
 
 
263 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.74 
 
 
256 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  46.81 
 
 
266 aa  246  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  45.53 
 
 
271 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  45.96 
 
 
251 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  45.61 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  44.49 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  45.61 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1274  undecaprenyl diphosphate synthase  45.96 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.278229  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  46.81 
 
 
251 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
249 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.95 
 
 
246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.39 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  49.17 
 
 
251 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  44.67 
 
 
251 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3049  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.38 
 
 
248 aa  242  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.66 
 
 
254 aa  242  7e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.49 
 
 
253 aa  241  7e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.49 
 
 
253 aa  241  7e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.58 
 
 
275 aa  241  9e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.58 
 
 
275 aa  241  9e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  46.58 
 
 
275 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  46.38 
 
 
251 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  45.6 
 
 
247 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
254 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.37 
 
 
247 aa  240  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.58 
 
 
246 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.15 
 
 
275 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  47.23 
 
 
248 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.85 
 
 
243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  46.15 
 
 
275 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.72 
 
 
249 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  46.15 
 
 
275 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  46.15 
 
 
275 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.72 
 
 
249 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1105  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.19 
 
 
251 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.177859  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.91 
 
 
249 aa  238  6.999999999999999e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45 
 
 
251 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45 
 
 
251 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  48.72 
 
 
248 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.36 
 
 
250 aa  238  1e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  45.73 
 
 
275 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  45.73 
 
 
275 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  46.15 
 
 
266 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
260 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  45.85 
 
 
249 aa  237  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  48.51 
 
 
257 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.4 
 
 
257 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  43.72 
 
 
252 aa  236  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.4 
 
 
258 aa  236  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.46 
 
 
258 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.46 
 
 
258 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.29 
 
 
251 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  46.05 
 
 
259 aa  235  8e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.06 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.06 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.06 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.22 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.06 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  47.41 
 
 
233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  47.03 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.54 
 
 
267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>