More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2085 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  93.05 
 
 
259 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  72.87 
 
 
257 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  67.07 
 
 
255 aa  334  7e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  71.84 
 
 
267 aa  329  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.93 
 
 
252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  64.23 
 
 
252 aa  308  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  65.09 
 
 
266 aa  308  8e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  62.96 
 
 
252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  66.23 
 
 
251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.96 
 
 
252 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.79 
 
 
252 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.16 
 
 
252 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  63.25 
 
 
247 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.68 
 
 
252 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  63.25 
 
 
247 aa  298  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  63.09 
 
 
254 aa  294  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3833  undecaprenyl diphosphate synthase  62.66 
 
 
260 aa  291  7e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0123862 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.55 
 
 
248 aa  288  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.14 
 
 
254 aa  286  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  61.14 
 
 
254 aa  286  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.23 
 
 
237 aa  284  9e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.97 
 
 
255 aa  280  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.04 
 
 
245 aa  261  8.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.55 
 
 
244 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
253 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
253 aa  243  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  53.98 
 
 
254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  51.27 
 
 
252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  47.64 
 
 
240 aa  242  5e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.34 
 
 
249 aa  241  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.3 
 
 
251 aa  241  7.999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  51.3 
 
 
252 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  54.19 
 
 
261 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  46.58 
 
 
248 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
256 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1439  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.95 
 
 
256 aa  239  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000108865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.25 
 
 
246 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.87 
 
 
251 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  51.53 
 
 
234 aa  240  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  53.62 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
263 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  51.53 
 
 
243 aa  238  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.67 
 
 
243 aa  239  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  48.52 
 
 
259 aa  238  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
246 aa  238  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  51.3 
 
 
264 aa  237  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.58 
 
 
247 aa  236  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.79 
 
 
256 aa  236  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  53.28 
 
 
244 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2707  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.85 
 
 
247 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1364  undecaprenyl diphosphate synthase  50.85 
 
 
247 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.59 
 
 
248 aa  236  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
266 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.46 
 
 
251 aa  236  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  50.85 
 
 
241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.74 
 
 
246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  47.83 
 
 
257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
256 aa  235  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
249 aa  234  7e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2151  undecaprenyl diphosphate synthase  54.19 
 
 
245 aa  234  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
249 aa  234  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.22 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  52.16 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.85 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.1 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  47.41 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1373  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.04 
 
 
236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0884424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.58 
 
 
257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  47.6 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  48.02 
 
 
251 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  53.04 
 
 
228 aa  233  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  46.26 
 
 
256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  51.29 
 
 
260 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  51.65 
 
 
275 aa  231  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  50.87 
 
 
253 aa  231  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  49.13 
 
 
245 aa  231  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  51.29 
 
 
260 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  51.29 
 
 
260 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.17 
 
 
259 aa  231  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.29 
 
 
233 aa  230  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.34 
 
 
249 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  46.98 
 
 
251 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  48.26 
 
 
240 aa  230  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  47.66 
 
 
276 aa  229  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  48.91 
 
 
249 aa  230  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  49.13 
 
 
265 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0265  undecaprenyl diphosphate synthase  49.13 
 
 
312 aa  230  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  51.28 
 
 
260 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  52.16 
 
 
260 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 
260 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 
260 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 
260 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 
260 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  52.16 
 
 
260 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  51.29 
 
 
260 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
253 aa  229  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.71 
 
 
260 aa  228  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>