More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0486 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0486  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
294 aa  585  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.407745 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3725  undecaprenyl diphosphate synthase  59.92 
 
 
251 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3651  undecaprenyl diphosphate synthase  59.92 
 
 
251 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.86266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3585  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.23 
 
 
251 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  56.54 
 
 
255 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  49.58 
 
 
253 aa  245  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.42 
 
 
249 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
276 aa  242  5e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  47.26 
 
 
272 aa  241  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.95 
 
 
282 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.04 
 
 
249 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
266 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  48.41 
 
 
251 aa  239  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.94 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  48.09 
 
 
246 aa  238  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.42 
 
 
251 aa  238  8e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.72 
 
 
245 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  48.32 
 
 
246 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  50.88 
 
 
256 aa  236  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  46.44 
 
 
282 aa  235  6e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
256 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.97 
 
 
259 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  45.61 
 
 
276 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.95 
 
 
246 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.69 
 
 
246 aa  232  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.72 
 
 
249 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4387  undecaprenyl diphosphate synthase  47.88 
 
 
250 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
247 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.11 
 
 
241 aa  231  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  47.26 
 
 
261 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.52 
 
 
246 aa  229  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45.99 
 
 
285 aa  228  8e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
254 aa  227  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.85 
 
 
253 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.85 
 
 
253 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  46.15 
 
 
264 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
249 aa  226  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  47.92 
 
 
273 aa  226  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  45.8 
 
 
240 aa  226  4e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  44.27 
 
 
263 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_002950  PG0190  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.36 
 
 
254 aa  226  5.0000000000000005e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.763759 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  41.53 
 
 
249 aa  225  6e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  43.93 
 
 
240 aa  225  8e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  45.45 
 
 
254 aa  224  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  47.06 
 
 
262 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  44.54 
 
 
288 aa  224  2e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  45.73 
 
 
271 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.08 
 
 
275 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.08 
 
 
275 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.08 
 
 
275 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3160  undecaprenyl diphosphate synthase  47.03 
 
 
253 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  48.26 
 
 
254 aa  223  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.42 
 
 
249 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  44.78 
 
 
248 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  44.4 
 
 
264 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.62 
 
 
267 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.98 
 
 
248 aa  223  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.98 
 
 
248 aa  223  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  44.81 
 
 
275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  44.81 
 
 
275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  44.81 
 
 
275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  44.67 
 
 
275 aa  222  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  45.12 
 
 
257 aa  222  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  44.81 
 
 
275 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.17 
 
 
247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45.15 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  51.77 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  45.53 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  45.73 
 
 
266 aa  220  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  49 
 
 
260 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.85 
 
 
251 aa  219  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  49 
 
 
260 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.54 
 
 
249 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  45.64 
 
 
260 aa  219  5e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.93 
 
 
253 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  45.93 
 
 
253 aa  219  6e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.93 
 
 
253 aa  219  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.93 
 
 
253 aa  219  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.93 
 
 
253 aa  219  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49 
 
 
260 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.58 
 
 
238 aa  218  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  44.4 
 
 
275 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0265  undecaprenyl diphosphate synthase  46.55 
 
 
312 aa  218  7.999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.47 
 
 
252 aa  218  8.999999999999998e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.58 
 
 
252 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.54 
 
 
249 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.55 
 
 
249 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  48.59 
 
 
260 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.79 
 
 
267 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  48.59 
 
 
260 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.31 
 
 
257 aa  217  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  48.59 
 
 
260 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  47.68 
 
 
248 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  51.75 
 
 
254 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  46.47 
 
 
252 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.15 
 
 
246 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  48.33 
 
 
260 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1373  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.33 
 
 
236 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0884424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.47 
 
 
252 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  44.74 
 
 
257 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>