More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3725 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3651  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
251 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.86266  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3725  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
251 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3585  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  95.62 
 
 
251 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  80.42 
 
 
255 aa  394  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0486  undecaprenyl diphosphate synthase  60.34 
 
 
294 aa  277  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.407745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  52.99 
 
 
246 aa  264  8e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.74 
 
 
256 aa  252  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.17 
 
 
249 aa  249  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.58 
 
 
249 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  51.03 
 
 
261 aa  249  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.13 
 
 
246 aa  248  9e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  53.85 
 
 
251 aa  245  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.92 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.75 
 
 
258 aa  242  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.82 
 
 
259 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  48.07 
 
 
264 aa  239  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.04 
 
 
251 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  52.52 
 
 
273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  52.19 
 
 
247 aa  239  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.71 
 
 
246 aa  237  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.61 
 
 
253 aa  237  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.61 
 
 
253 aa  237  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.56 
 
 
246 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  46.64 
 
 
282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.29 
 
 
251 aa  235  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  47.44 
 
 
264 aa  234  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
276 aa  234  9e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  48.72 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  47.46 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  47.46 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  47.46 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  49.12 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  47.46 
 
 
275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.57 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  47.37 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  47.88 
 
 
266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  47.01 
 
 
260 aa  233  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  47.03 
 
 
275 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  48.95 
 
 
266 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
240 aa  232  5e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  51 
 
 
262 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.03 
 
 
275 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.03 
 
 
275 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  47.86 
 
 
256 aa  231  9e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  45.64 
 
 
263 aa  231  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1877  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.27 
 
 
261 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  46 
 
 
272 aa  231  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  49.12 
 
 
256 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.02 
 
 
247 aa  230  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.66 
 
 
256 aa  229  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  50.87 
 
 
254 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.66 
 
 
256 aa  229  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.57 
 
 
245 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.61 
 
 
275 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
246 aa  229  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  46.61 
 
 
275 aa  229  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.44 
 
 
258 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1746  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.29 
 
 
253 aa  229  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.44 
 
 
258 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0661  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
265 aa  229  4e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.896818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.62 
 
 
258 aa  229  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2451  undecaprenyl diphosphate synthase  50.64 
 
 
260 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351956  hitchhiker  0.00162806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.62 
 
 
257 aa  229  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.44 
 
 
258 aa  229  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  45.88 
 
 
254 aa  228  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
260 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
260 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  46.4 
 
 
276 aa  228  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5325  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.07 
 
 
260 aa  228  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00863948  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6062  undecaprenyl diphosphate synthase  51.07 
 
 
260 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2035  undecaprenyl diphosphate synthase  51.07 
 
 
260 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  51.07 
 
 
260 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
257 aa  228  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  52.34 
 
 
261 aa  228  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.03 
 
 
258 aa  228  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.03 
 
 
258 aa  228  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.03 
 
 
258 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.03 
 
 
258 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  51.32 
 
 
248 aa  228  9e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
260 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  51.07 
 
 
260 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.13 
 
 
257 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2048  undecaprenyl diphosphate synthase  51.07 
 
 
260 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  50.85 
 
 
248 aa  227  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
260 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
260 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  47.32 
 
 
236 aa  226  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1261  undecaprenyl diphosphate synthase  51.07 
 
 
260 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.12657  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.78 
 
 
267 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  48.21 
 
 
241 aa  226  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  50.64 
 
 
260 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  45.96 
 
 
271 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
260 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
260 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1227  undecaprenyl diphosphate synthase  52.14 
 
 
244 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0880446  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  46.12 
 
 
236 aa  226  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
257 aa  225  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1686  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.79 
 
 
260 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184494 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.15 
 
 
258 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  46.19 
 
 
266 aa  225  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>