More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7038 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
299 aa  612  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  70.56 
 
 
256 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  69.29 
 
 
261 aa  363  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  69.02 
 
 
262 aa  359  3e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.67 
 
 
286 aa  359  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  66.4 
 
 
271 aa  358  4e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  65.65 
 
 
279 aa  358  5e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  63.88 
 
 
275 aa  358  9e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  68.92 
 
 
273 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  73.39 
 
 
250 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  70.12 
 
 
264 aa  353  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  63.75 
 
 
288 aa  352  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.57 
 
 
269 aa  350  2e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.4 
 
 
271 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  68.38 
 
 
259 aa  348  8e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  67.07 
 
 
261 aa  347  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.94 
 
 
264 aa  346  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.72 
 
 
282 aa  345  7e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  66.53 
 
 
262 aa  342  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  69.72 
 
 
273 aa  342  5e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  65.79 
 
 
276 aa  341  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  66.93 
 
 
270 aa  338  9e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  61.96 
 
 
264 aa  338  9e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  67.33 
 
 
260 aa  334  9e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  66.67 
 
 
260 aa  329  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  66.4 
 
 
333 aa  324  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  59.47 
 
 
269 aa  319  3e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  64.57 
 
 
265 aa  316  4e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  60.48 
 
 
296 aa  315  5e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  68.75 
 
 
228 aa  315  5e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  58.4 
 
 
264 aa  306  3e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.66 
 
 
298 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.66 
 
 
298 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  56.1 
 
 
262 aa  301  7.000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.66 
 
 
298 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  57.14 
 
 
231 aa  285  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  58.57 
 
 
287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  56.71 
 
 
230 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  56.03 
 
 
241 aa  250  3e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  46.9 
 
 
564 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.37 
 
 
244 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  45.14 
 
 
264 aa  219  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.38 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.49 
 
 
233 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  44.54 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.39 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.46 
 
 
222 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
252 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.32 
 
 
252 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  45.65 
 
 
239 aa  212  5.999999999999999e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  44.4 
 
 
248 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.89 
 
 
252 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.96 
 
 
259 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  43.67 
 
 
291 aa  209  6e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  44.4 
 
 
254 aa  208  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  45.41 
 
 
247 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.49 
 
 
256 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  46.96 
 
 
257 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  43.48 
 
 
266 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.09 
 
 
252 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.97 
 
 
253 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.97 
 
 
253 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.96 
 
 
249 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.26 
 
 
252 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.01 
 
 
233 aa  206  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.12 
 
 
249 aa  206  3e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  41.98 
 
 
276 aa  205  6e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
247 aa  205  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  43.64 
 
 
272 aa  205  7e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
247 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
252 aa  205  8e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  46.32 
 
 
243 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.28 
 
 
246 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.13 
 
 
247 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  44.44 
 
 
259 aa  203  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  42.31 
 
 
246 aa  203  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.17 
 
 
258 aa  202  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  42.17 
 
 
263 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.85 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.03 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.45 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  42.17 
 
 
240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  44.35 
 
 
254 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  43.23 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.12 
 
 
249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  45.22 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.1 
 
 
248 aa  199  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3513  undecaprenyl diphosphate synthase  45.41 
 
 
230 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.161078  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.3 
 
 
251 aa  198  7.999999999999999e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  41.48 
 
 
282 aa  198  9e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  44.74 
 
 
254 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 
260 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.7 
 
 
249 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.5 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  38.86 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.48 
 
 
238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.41 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  44.78 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.09 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.05 
 
 
238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>