More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1664 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1664  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
250 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.160795  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3373  undecaprenyl diphosphate synthase  79.6 
 
 
256 aa  401  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  decreased coverage  0.00980293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1932  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  77.2 
 
 
271 aa  397  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.990024  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0796  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  79.2 
 
 
269 aa  394  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1177  undecaprenyl diphosphate synthase  73.6 
 
 
261 aa  391  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2756  undecaprenyl diphosphate synthase  74.19 
 
 
271 aa  389  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.413102  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13560  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  74.49 
 
 
279 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7038  undecaprenyl diphosphate synthase  73.39 
 
 
299 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0853  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  79.35 
 
 
282 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.563671  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3152  undecaprenyl diphosphate synthase  76.61 
 
 
276 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3231  undecaprenyl diphosphate synthase  76 
 
 
264 aa  374  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0144066  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11790  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  72.47 
 
 
264 aa  374  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0184207  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1961  undecaprenyl diphosphate synthase  70.97 
 
 
275 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000271521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1858  undecaprenyl diphosphate synthase  82.59 
 
 
273 aa  371  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00462949  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2041  undecaprenyl diphosphate synthase  74.9 
 
 
262 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0238764  normal  0.7492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2188  undecaprenyl diphosphate synthase  77.73 
 
 
261 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3446  undecaprenyl diphosphate synthase  78.14 
 
 
270 aa  370  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal  0.0362391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0730  undecaprenyl diphosphate synthase  74.6 
 
 
273 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2224  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  69.76 
 
 
286 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.217597  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3825  undecaprenyl diphosphate synthase  77.33 
 
 
260 aa  368  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0278068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13650  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  68.4 
 
 
264 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.597201  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2336  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  72 
 
 
259 aa  361  7.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2176  undecaprenyl diphosphate synthase  71.26 
 
 
262 aa  360  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.185342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1256  undecaprenyl diphosphate synthase  67.87 
 
 
288 aa  355  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598432  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  74.09 
 
 
260 aa  349  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12387  undecaprenyl pyrophosphate synthase  69.23 
 
 
296 aa  348  6e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258398  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2119  undecaprenyl diphosphate synthase  73.49 
 
 
333 aa  343  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1767  undecaprenyl diphosphate synthase  76.13 
 
 
228 aa  343  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  66.27 
 
 
269 aa  344  1e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1273  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  70.8 
 
 
265 aa  342  5e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.519707  normal  0.154867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3449  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.16 
 
 
298 aa  326  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3512  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.16 
 
 
298 aa  326  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198218  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3460  undecaprenyl pyrophosphate synthase  63.16 
 
 
298 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.872209  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12280  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  63.6 
 
 
287 aa  312  2.9999999999999996e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3822  undecaprenyl diphosphate synthase  63.04 
 
 
231 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0869311  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2714  undecaprenyl diphosphate synthase  61.74 
 
 
230 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0119  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.44 
 
 
262 aa  298  4e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0451  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  57.32 
 
 
264 aa  298  5e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.40895 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1266  undecaprenyl diphosphate synthase  63.36 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  53.33 
 
 
244 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.08 
 
 
252 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.08 
 
 
252 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.42 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1320  undecaprenyl diphosphate synthase  47.77 
 
 
564 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165638  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.99 
 
 
252 aa  232  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  50.2 
 
 
254 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  52.63 
 
 
257 aa  229  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.42 
 
 
252 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.67 
 
 
252 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  49.38 
 
 
254 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
243 aa  226  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1402  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  51.79 
 
 
222 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  51.08 
 
 
264 aa  226  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.52 
 
 
251 aa  225  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.17 
 
 
251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  49.56 
 
 
266 aa  225  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.6 
 
 
233 aa  225  7e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.37 
 
 
256 aa  221  9e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  46.75 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0361  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.05 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.57 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.44 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0326  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.05 
 
 
255 aa  219  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
247 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
255 aa  218  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  49.12 
 
 
247 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.67 
 
 
252 aa  218  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.64 
 
 
249 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.88 
 
 
237 aa  216  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.03 
 
 
233 aa  215  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.8 
 
 
249 aa  214  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  43.04 
 
 
248 aa  214  8e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  46 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.49 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.48 
 
 
238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.84 
 
 
249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.54 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1261  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.44 
 
 
255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  45.18 
 
 
234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2457  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.8 
 
 
241 aa  212  5.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413258 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.84 
 
 
249 aa  211  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.98 
 
 
247 aa  211  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  44.53 
 
 
262 aa  211  9e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.04 
 
 
238 aa  211  9e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  42.39 
 
 
264 aa  211  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.3 
 
 
243 aa  211  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.76 
 
 
260 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  44.35 
 
 
263 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  44.3 
 
 
249 aa  211  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  43.42 
 
 
240 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.02 
 
 
245 aa  210  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.1 
 
 
267 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  50.44 
 
 
254 aa  209  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  49.33 
 
 
259 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  44.44 
 
 
256 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.53 
 
 
249 aa  209  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  46.85 
 
 
259 aa  209  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.13 
 
 
258 aa  209  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.49 
 
 
253 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.49 
 
 
253 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>