More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2801 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2801  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0010789  normal  0.698237 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  55.95 
 
 
245 aa  263  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.56 
 
 
244 aa  257  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
247 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  49.15 
 
 
247 aa  248  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0299  undecaprenyl diphosphate synthase  51.32 
 
 
266 aa  247  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0433049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.63 
 
 
237 aa  246  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1855  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223709  normal  0.0619844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1536  undecaprenyl diphosphate synthase  50.41 
 
 
257 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.78 
 
 
259 aa  242  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  48.9 
 
 
254 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.72 
 
 
252 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.03 
 
 
267 aa  238  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4435  undecaprenyl diphosphate synthase  48.19 
 
 
255 aa  238  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000718481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2555  undecaprenyl diphosphate synthase  51.11 
 
 
254 aa  238  9e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0643288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.93 
 
 
252 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2085  undecaprenyl diphosphate synthase  49.56 
 
 
259 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2359  undecaprenyl diphosphate synthase  49.56 
 
 
259 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  48.9 
 
 
266 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
252 aa  235  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0369  undecaprenyl diphosphate synthase  49.6 
 
 
254 aa  234  9e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0423847  normal  0.155324 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.14 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.14 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2045  undecaprenyl diphosphate synthase  50.88 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  0.172176 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
254 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.57 
 
 
267 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.78 
 
 
255 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2603  undecaprenyl diphosphate synthase  48.1 
 
 
247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.93 
 
 
267 aa  231  6e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.81 
 
 
252 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.25 
 
 
252 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.25 
 
 
252 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.9 
 
 
251 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.34 
 
 
254 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  46.26 
 
 
256 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0633  undecaprenyl diphosphate synthase  48.25 
 
 
267 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.93 
 
 
258 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.93 
 
 
258 aa  228  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.93 
 
 
258 aa  228  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.93 
 
 
258 aa  228  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.93 
 
 
258 aa  228  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.78 
 
 
249 aa  228  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.93 
 
 
258 aa  228  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.93 
 
 
258 aa  228  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.81 
 
 
247 aa  228  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  47.16 
 
 
264 aa  228  9e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.93 
 
 
258 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  45.81 
 
 
263 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.81 
 
 
267 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3833  undecaprenyl diphosphate synthase  49.56 
 
 
260 aa  227  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0123862 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.06 
 
 
248 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.49 
 
 
257 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
260 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.49 
 
 
258 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  46.67 
 
 
244 aa  226  4e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.4 
 
 
252 aa  225  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.05 
 
 
257 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  45.61 
 
 
257 aa  225  7e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  49.12 
 
 
236 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2423  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.89 
 
 
257 aa  224  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  42.98 
 
 
248 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
236 aa  223  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.76 
 
 
256 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.05 
 
 
258 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  45.81 
 
 
251 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.11 
 
 
246 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2579  undecaprenyl diphosphate synthase  48.44 
 
 
260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  48.44 
 
 
260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17110  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.44 
 
 
251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.608535  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  47.79 
 
 
244 aa  222  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.44 
 
 
260 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0292825  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.46 
 
 
265 aa  222  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  45.78 
 
 
261 aa  222  6e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  47.16 
 
 
252 aa  222  6e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  49.12 
 
 
248 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1595  undecaprenyl diphosphate synthase  47.56 
 
 
251 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4182  undecaprenyl diphosphate synthase  47.56 
 
 
251 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1150  undecaprenyl diphosphate synthase  47.56 
 
 
251 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1487  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.44 
 
 
251 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.7 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2052  undecaprenyl diphosphate synthase  48 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1551  undecaprenyl diphosphate synthase  48 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.7 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1227  undecaprenyl diphosphate synthase  49.33 
 
 
244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0880446  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4078  undecaprenyl diphosphate synthase  47.11 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3259  undecaprenyl diphosphate synthase  48 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540086  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88710  predicted protein  47.03 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0116194  decreased coverage  0.00230003 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1324  undecaprenyl diphosphate synthase  48 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.134804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1538  undecaprenyl diphosphate synthase  45.73 
 
 
251 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.950032  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
228 aa  219  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  46.26 
 
 
240 aa  219  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2581  undecaprenyl diphosphate synthase  48.89 
 
 
244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.181567  normal  0.0357168 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.26 
 
 
256 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  43.61 
 
 
240 aa  218  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  46.67 
 
 
245 aa  218  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  43.56 
 
 
251 aa  218  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  44.89 
 
 
246 aa  218  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1276  undecaprenyl diphosphate synthase  46.46 
 
 
243 aa  218  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0784677  normal  0.545818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1347  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  47.11 
 
 
251 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0230292  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.59 
 
 
249 aa  218  7e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>