More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0355 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
236 aa  481  1e-135  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  86.44 
 
 
236 aa  430  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  84.75 
 
 
236 aa  423  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
234 aa  263  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  50.45 
 
 
244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  50.67 
 
 
241 aa  250  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  49.55 
 
 
233 aa  246  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  50.67 
 
 
236 aa  246  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.73 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.85 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
258 aa  242  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
258 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
258 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.72 
 
 
257 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
257 aa  243  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
236 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
258 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
245 aa  240  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.72 
 
 
258 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.01 
 
 
253 aa  240  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.01 
 
 
253 aa  240  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
249 aa  240  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.33 
 
 
243 aa  239  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  46.98 
 
 
239 aa  237  9e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.93 
 
 
250 aa  235  4e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  47.53 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  47.14 
 
 
272 aa  234  7e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  46.93 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.58 
 
 
249 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  47.58 
 
 
276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  46.55 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  45.85 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.07 
 
 
249 aa  231  8.000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.26 
 
 
246 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  46.22 
 
 
232 aa  229  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  46.12 
 
 
256 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
255 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.26 
 
 
256 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.34 
 
 
254 aa  228  8e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.34 
 
 
254 aa  227  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1945  undecaprenyl diphosphate synthase  45.65 
 
 
231 aa  227  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.77987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.85 
 
 
249 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.48 
 
 
255 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.54 
 
 
249 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.7 
 
 
249 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  45.37 
 
 
240 aa  225  4e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  46.72 
 
 
240 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  47.58 
 
 
253 aa  225  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.41 
 
 
259 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0944  undecaprenyl diphosphate synthase  46.64 
 
 
230 aa  223  1e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0337161  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  44.54 
 
 
266 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  46.7 
 
 
252 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  46.26 
 
 
285 aa  223  2e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  46.22 
 
 
228 aa  223  2e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2435  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.72 
 
 
244 aa  223  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000170517  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  46.7 
 
 
276 aa  222  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  45.81 
 
 
251 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1493  undecaprenyl diphosphate synthase  45.53 
 
 
250 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0979  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.69 
 
 
254 aa  223  3e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00602167  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  45.37 
 
 
282 aa  222  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.14 
 
 
251 aa  222  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.05 
 
 
246 aa  222  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2975  undecaprenyl diphosphate synthase  47.37 
 
 
253 aa  222  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.26 
 
 
259 aa  222  4e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
248 aa  222  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2344  undecaprenyl diphosphate synthase  49.32 
 
 
227 aa  221  6e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0350605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.23 
 
 
256 aa  221  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.23 
 
 
256 aa  221  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.1 
 
 
249 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  44.05 
 
 
246 aa  221  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0827  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.67 
 
 
256 aa  221  7e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000549234  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  44.54 
 
 
252 aa  220  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.98 
 
 
247 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3585  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.28 
 
 
251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0518  undecaprenyl diphosphate synthase  47.53 
 
 
280 aa  219  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.72 
 
 
248 aa  219  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.49 
 
 
256 aa  219  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  46.96 
 
 
254 aa  219  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  46.7 
 
 
273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  43.86 
 
 
240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1163  undecaprenyl diphosphate synthase  48.02 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  46.12 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.67 
 
 
249 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.1 
 
 
252 aa  218  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  45.65 
 
 
260 aa  218  6e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  43.53 
 
 
254 aa  218  7e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.1 
 
 
241 aa  218  7e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.75 
 
 
245 aa  218  7e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3785  undecaprenyl diphosphate synthase  46.38 
 
 
252 aa  218  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218276  hitchhiker  0.00197218 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  44.49 
 
 
247 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2471  undecaprenyl diphosphate synthase  44.4 
 
 
259 aa  217  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3651  undecaprenyl diphosphate synthase  47.19 
 
 
251 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.86266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.16 
 
 
267 aa  217  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0052  undecaprenyl diphosphate synthase  47.11 
 
 
231 aa  217  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000100505  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  44.44 
 
 
257 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3355  undecaprenyl diphosphate synthase  45.23 
 
 
253 aa  217  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0813466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>